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J-GLOBAL ID：201902291919403439   整理番号：19A1806662

トロンビン陰イオン結合エキソサイトIの成熟に関連した立体配座変化の解読【JST・京大機械翻訳】

Deciphering Conformational Changes Associated with the Maturation of Thrombin Anion Binding Exosite I

著者 (4件)： Billur Ramya (Department of Chemistry, University of Louisville, Kentucky, United States) ,  Ban David (Department of Medicine, James Graham Brown Cancer Center, University of Louisville, Kentucky, United States) ,  Sabo T. Michael (Department of Medicine, James Graham Brown Cancer Center, University of Louisville, Kentucky, United States) ,  Maurer Muriel C. (Department of Chemistry, University of Louisville, Kentucky, United States)
資料名： Biochemistry  (Biochemistry)
巻： 56  号： 48  ページ： 6343-6354  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0270B  ISSN： 0006-2960  CODEN： BICHAW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： トロンビンは凝固,抗凝固,血小板活性化に関与する。この酵素はアニオン結合エキソサイト,ABE I及びABE IIを含み,調節性生体分子を誘引する。プロトロンビンはトロンビンに活性化されるので,プロABE Iは成熟ABEに変換される。予想外に,特定の配位子はプロ-ABE Iに特異的に結合することができる。さらに,プロABE Iとして個々の残基レベルで生じる立体配座と親和性の変化の知識は,ABE Iに変換される。このような変化は過渡的であり,結晶学によって捉えられなかった。したがって,核磁気共鳴(NMR)滴定を用いて,プロテアーゼ活性化受容体3(PAR3)に基づくペプチドを用いてABE Iの発生をモニターした。プロトン線広がりNMRは,PAR3(44-56)とより弱く結合するPAR3G(44-56)がプロトロンビン上でプロ-ABE Iと既に相互作用することを明らかにした。次いで,1H-15Nヘテロ核単一量子コヒーレンスNMR滴定を用いて,個々の15N標識PAR3G残基(F47,E48,L52及びD54)の結合をプローブした。PAR3G E48とD54はプロトロンビンと静電的に相互作用し,トロンビン成熟により強化された。PAR3G D54に対するより高い親和性は,トロンビンR77aを囲む領域がPAR3G E48とトロンビンR75の間の相互作用よりD54を結合するのにより良く配向していることを示唆する。芳香族PAR3G F47と脂肪族L52は,プロトロンビンのトロンビンへの変換による化学的環境の有意な変化を報告した。30秒ループを囲むABE I領域は疎水性ポケット(F34,L65及びI82)よりも影響を受けた。NMR滴定により,PAR3残基は,報告されたX線結晶構造により見逃されたエキソサイト成熟時に生じる構造的再配列を証明することを示した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： プローブ ,  結晶構造 ,  相互作用 ,  滴定 ,  ペプチド ,  プロトロンビン ,  疎水性 ,  *トロンビン ,  NMR【磁気共鳴】 ,  陽子 ,  *立体配座 ,  凝固 ,  *配座転移 ,  親和性
準シソーラス用語： 残基 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 線維素溶解・血液凝固  (EJ03040S) ,  生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (5件)： トロンビン ,  陰イオン結合 ,  成熟 ,  立体配座変化 ,  解読