資源
J-GLOBAL ID:201910015648365800   研究資源コード:NBDC02402 更新日:2019年01月16日

TEC database: Transcription Profile of Escherichia coli database

TEC database: Transcription Profile of Escherichia coli database
保有機関:
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (4件): ゲノム/遺伝子 ,  DNA ,  タンパク質 ,  個体/種
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  相互作用/パスウェイ
生物種 (1件): Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562)
概要:
大腸菌の全シグマ因子・転写因子とその制御標的遺伝子セットを格納したデータベースです。新規に開発したGonomic SELEX法により、全シグマ因子・転写因子の認識配列を同定しています。転写因子を指定しての制御標的遺伝子リスト、ゲノム上の結合部位と強度を示すSELEXパターンやヒートマップ、複数の転写因子の結合部位パターンの同一画面上での表示など、多様な検索が可能です。Cytoscapeを利用して遺伝子制御ネットワークを生成することもできます。SELEX実験データのダウンロードも可能です。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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