TEC database: Transcription Profile of Escherichia coli database

保有機関：

情報・システム研究機構国立遺伝学研究所生物遺伝資源情報総合センター
TEC group

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (4件)：ゲノム/遺伝子 , DNA , タンパク質 , 個体/種

タグ【データの種類】 (2件)：配列 , 相互作用/パスウェイ

生物種 (1件)： Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562)

概要：

大腸菌の全シグマ因子・転写因子とその制御標的遺伝子セットを格納したデータベースです。新規に開発したGonomic SELEX法により、全シグマ因子・転写因子の認識配列を同定しています。転写因子を指定しての制御標的遺伝子リスト、ゲノム上の結合部位と強度を示すSELEXパターンやヒートマップ、複数の転写因子の結合部位パターンの同一画面上での表示など、多様な検索が可能です。Cytoscapeを利用して遺伝子制御ネットワークを生成することもできます。SELEX実験データのダウンロードも可能です。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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