資源
J-GLOBAL ID:201910016134308340
研究資源コード:NBDC02394
更新日:2019年01月08日
AlliumTDB
AlliumTDB
保有機関:
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (1件):
ゲノム/遺伝子
タグ【データの種類】 (2件):
配列
, 発現
生物種 (4件):
Allium cepa (NCBI Taxonomy ID: 4679)
, Allium cepa var. aggregatum (NCBI Taxonomy ID: 28911)
, Allium roylei (NCBI Taxonomy ID: 48874)
, Allium fistulosum (NCBI Taxonomy ID: 35875)
概要:
ネギ属のトランスクリプトームデータベースです。次世代シークエンサーによるRNA-Seqで、日本ネギ(A. fistulosum, FF)、Shallot (A. cepa Aggregatum group, AA)、Shallot由来の余分な染色体を持つ日本ネギの一染色体添加型系統(monosomic addition lines; MALs)、野生種(A. roylei)を材料に葉、球根、根、茎などを解析した結果を収録しています。遺伝子ごとに、配列、発現プロファイル、公開DBに対するBLAST検索データ、各データセット間での相同遺伝子の情報を閲覧できます。BLAST検索、キーワード検索が可能です。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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