研究者
J-GLOBAL ID：202001000004292908   更新日: 2024年04月13日

石坂 優人

イシザカ マサト | Ishizaka Masato
所属機関・部署：
ゲッティンゲン大学 ゲッティンゲン大学医療センター (UMG), 神経病理学研究所

ゲッティンゲン大学 ゲッティンゲン大学医療センター (UMG), 神経病理学研究所 について


職名： 博士研究員
ホームページURL (1件)： https://www.uni-goettingen.de/en/198266.html
研究分野 (4件)： 細胞生物学 ,  分子生物学 ,  生物物理学 ,  構造生物化学
研究キーワード (12件)： タンパク質 ,  酵素 ,  反応機構 ,  X線結晶構造解析 ,  速度論解析 ,  変異体解析 ,  クライオ電子顕微鏡 ,  クライオ電子線トモグラフィー ,  脱炭酸酵素 ,  タンパク質分解酵素 ,  鉄硫黄クラスター ,  tRNA硫黄修飾
競争的資金等の研究課題 (7件)：
  • 2023 - 2024 アセト酢酸脱炭酸酵素における触媒残基のpKa制御機構
  • 2022 - 2023 鉄硫黄クラスターを利用する核酸結合酵素の反応機構解明
  • 2021 - 2023 鉄硫黄クラスターを持つtRNA硫黄修飾酵素が異なる二つの反応を制御する機構の解明
  • 2021 - 2022 空気中で失活するtRNA硫黄修飾酵素が特殊な基質tRNAを認識する分子機構の解明
  • 2020 - 2021 tRNA硫黄修飾酵素TtuAの鉄硫黄クラスター構造と酵素活性の相関性
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論文 (6件)：
  • 関川卓也, 松谷悠佑, Hwang Beomju, 石坂優人, 川井弘之, 大野義章, 佐藤達彦, 甲斐健師. Changes in molecular conformation and electronic structure of DNA under 12C ions based on first-principles calculations. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section B. 2024. 548. 165231-165231
  • 鈴木千幸, 長瀬雅揮, 吉村照毅, 石坂優人, 姚閔, 尾瀬農之, 岡田知晃. Expression, purification, and preliminary X-ray crystal diffraction analysis of the Saccharomyces cerevisiae phosphomevalonate kinase. Crystallography Reports. 2023. 68. 1. 57-61
  • 石坂優人. 鉄硫黄クラスター含有酵素が触媒するtRNA硫黄修飾の反応機構解析. 学位論文. 2023
  • 石坂優人, 陳明皓, 奈良井峻, 田中良和, 尾瀬農之, 堀谷正樹, 姚閔. Quick and spontaneous transformation between [3Fe-4S] and [4Fe-4S] iron-sulfur clusters in the tRNA-thiolation enzyme TtuA. International Journal of Molecular Sciences. 2023. 24. 1. 833-833
  • 陳明皓, 石坂優人, 奈良井峻, 堀谷正樹, 鴫直樹, 姚閔, 田中良和. The [4Fe-4S] cluster of sulfurtransferase TtuA desulfurizes TtuB during tRNA modification in Thermus thermophilus. Communications Biology. 2020. 3. 168
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MISC (8件)：
  • 石坂優人, 辰本彩香. 積極性が鍵! 海外 PDポストの内定体験記. 実験医学. 2023. 41. 11. 1833-1833
  • 石坂優人, 青木聡樹. クラウドファンディングに挑戦!大学院生の研究費獲得ノウハウ. 実験医学. 2022. 40. 11. 1803-1803
  • 石坂優人. 博士後期課程の経済事情 〜学会を財源とする給付型奨学金の提案〜. 実験医学. 2021. 39. 8. 1309-1309
  • 石坂 優人. 第60回生物物理若手の会夏の学校開催報告. 生物物理. 2020. 60. 6. 367-368
  • 石坂 優人. 第60回生物物理若手の会 夏の学校のご案内 ~北海道支部開催~. 生物物理. 2020. 60. 3. 196-197
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講演・口頭発表等 (33件)：
  • 酸化還元感受性の鉄硫黄クラスターを利用するtRNA硫黄修飾酵素の反応機構
    (第60回日本生物物理学会年会 2022)
  • 大気中で活性を失う酵素がtRNA硫黄修飾を触媒する反応機構
    (第62回生物物理若手の会夏の学校 2022)
  • 大気中で失活するtRNA硫黄修飾酵素が2-チオウリジン合成を触媒する反応機構
    (第62回生命科学夏の学校 2022)
  • 大気中で活性を失う鉄硫黄酵素が2-チオウリジン合成を触媒する分子機構
    (第61回分子科学若手の会夏の学校 2022)
  • 酸化に脆弱な酵素がtRNAのチオウリジン合成を触媒する
    (The 13th CSE Summer School & 10th ALP International Symposium 2022)
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学歴 (3件)：
  • 2020 - 2023 北海道大学 大学院生命科学院 生命融合科学コース
  • 2018 - 2020 北海道大学大学院 生命科学院 生命融合科学コース
  • 2014 - 2018 北海道大学 理学部 生物科学科 (高分子機能学専修分野)
学位 (1件)：
  • 博士(生命科学) (北海道大学)
経歴 (6件)：
  • 2024/04 - 現在 ゲッティンゲン大学 ゲッティンゲン大学医療センター (UMG), 神経病理学研究所 博士研究員
  • 2023/04 - 2024/03 ゲッチンゲン大学 ゲッティンゲン分子生物科学センター (GZMB), 分子酵素学部門 博士研究員
  • 2022/05 - 2023/03 理化学研究所 計算科学研究センター (R-CCS) 理論分子科学研究室
  • 2021/04 - 2023/03 日本学術振興会特別研究員(学振DC2)
  • 2018/10 - 2023/03 博士課程教育リーディングプログラム 北海道大学 物質科学フロンティアを開拓するAmbitiousリーダー育成プログラム (ALP) 5期生
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委員歴 (9件)：
  • 2020/10 - 2024/03 生化学若い研究者の会 キュベット委員会 実行委員
  • 2022/10 - 2023/08 生化学若い研究者の会 キュベット委員会 委員長
  • 2021/09 - 2023/08 生化学若い研究者の会 キュベット委員会 実験医学班 班長
  • 2021/01 - 2021/12 生物物理若手の会 会長
  • 2020/12 - 2021/12 蛋白質科学会若手の会 実行委員
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受賞 (14件)：
  • 2023/03 - 北海道大学大学院 生命科学院 生命融合科学/ソフトマターコース IGP 2022 Publications Award (博士後期課程の首席修了者5名の1名)
  • 2021/08 - 生化学若い研究者の会 第61回生命科学夏の学校デザイン賞 tRNA成熟化酵素における非ヘム鉄構造の矛盾の解明
  • 2020/09 - 日本生物物理学会 第58回日本生物物理学会ポスター賞 tRNA硫黄修飾酵素における鉄硫黄クラスター構造と酵素活性の相関解析
  • 2020/02 - 北海道大学大学院 生命科学院 生命融合科学コース 成績最優秀賞 (博士前期課程の首席修了)
  • 2020/02 - 北海道大学大学院生命科学院 生命融合科学コース 修士論文発表会優秀発表賞 鉄硫黄クラスターが担うtRNA硫黄修飾の反応機構解明
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所属学会 (3件)：
日本結晶学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  日本生物物理学会
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