北村勇吉

キタムラユウキチ | Yuhkichi Kitamura

所属機関・部署：
職名：助教

研究分野 (2件)：計算科学 , 基礎物理化学

研究キーワード (9件)： Quantum chemical method , molecular simulation , Condensed phase system , 量子化学法 , 分子シミュレーション , 凝集相系 , 溶液化学 , 計算化学 , 理論化学

競争的資金等の研究課題 (6件)：

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論文 (17件)：

Yukichi Kitamura, Hajime Torii. Theoretical analysis toward better description of the wavenumber shifts of the OH stretch of hydrogen-bonded water. Journal of Raman Spectroscopy. 2022
Carlos Bistafa, Yukichi Kitamura, Masataka Nagaoka. Theoretical prediction of pH-dependent electronic spectra in aqueous solution: A combinational application of QM/MM calculations and constant-pH simulations with configuration-selection scheme. Chemical Physics Letters. 2022. 798. 139624-139624
Kei TAKAMI, Yukichi KITAMURA, Masataka NAGAOKA. Performance Research of Clustering Methods for Detecting State Transition Trajectories in Hemoglobin. Journal of Computer Chemistry, Japan. 2021. 19. 4. 154-157
Yukichi Kitamura, Masataka Nagaoka. A Constant-pH Hybrid Monte Carlo Method with a Configuration-Selection Scheme Using the Zero Energy Difference Condition: Elucidation of Molecular Diffusivity Correlated with a pH-Dependent Solvation Shell. Journal of Chemical Theory and Computation. 2021. 17. 2. 1030-1044
Ikuo Kurisaki, Yume Takahashi, Yukichi Kitamura, Masataka Nagaoka. Chloride Ions Stabilize Human Adult Hemoglobin in T-State, Competing with Allosteric Interaction of Oxygen Molecules. The Journal of Physical Chemistry B. 2021

MISC (1件)：

北村勇吉. 博士論文紹介「グリシン水溶液における微視的溶媒効果に関する理論的研究」ー自由エネルギー勾配法の新展開:振動双解析法ー」. 分子シミュレーション研究会会誌“アンサンブル”. 2016. 18. 2. 115-122

書籍 (4件)：

Molecular Technology, Volume 3: Materials Innovation, Eds. H. Yamamoto and T. Kato
Wiley-VCH 2019 ISBN:9783527341610
Quantum Modeling of Complex Molecular Systems (Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics), Eds. J.-L. Rivail. Manuel F. Ruiz-López and X. Assfeld
Springer 2015
Quantum Modeling of Complex Molecular Systems (Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics), Eds. J.-L. Rivail. Manuel F. Ruiz-López and X. Assfeld,
Springer 2015 ISBN:9783319216256
Practical Aspects of Computational Chemistry III, Eds. M. Shukla and J. Leszczynski
Springer 2012 ISBN:9789400709188

講演・口頭発表等 (37件)：

伸縮振動モードの振動数予測モデルにおける記述子の解析
(凝集系の理論化学研究会 2023)
Theoretical analysis toward better description of the frequency shifts of the OH stretch of hydrogen-bonded water
(Asia-Pacific Association of Theoretical and Computational Chemists (APCTCC-10) 2023)
Histidine Protonation State Regulates the Structural Stability of R state Hemoglobin
(Asia-Pacific Association of Theoretical and Computational Chemists (APCTCC-10) 2023)
GPU版配置選択pH(CS-CpH)法の開発とその応用
(第36回分子シミュレーション討論会 2022)
Theoretical analysis toward better description of the frequency shifts of the OH stretch of hydrogen-bonded water
(第45回ケモインフォマティクス討論会 2022)

学歴 (1件)：

学位 (1件)：

経歴 (2件)：

受賞 (6件)：

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所属学会 (6件)：

溶液化学研究会 , 日本化学会 , 理論化学会 , 日本コンピュータ化学会 , 分子科学会 , 分子シミュレーション学会

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北村 勇吉