研究者
J-GLOBAL ID:202001007108403501   更新日: 2024年04月04日

西 羽美

ニシ ハフミ | NISHI HAFUMI
所属機関・部署:
研究キーワード (1件): バイオインフォマティクス
競争的資金等の研究課題 (7件):
  • 2022 - 2025 タンパク質立体構造に基づく分子機能部位の網羅的解析と細胞機能の理解への展開
  • 2023 - Google exploreCSR Award 2023
  • 2022 - 2023 AlphaFold予測構造の高精度化とそれに基づくSLCトランスポーターの網羅的ゲノム変異解析
  • 2022 - Google exploreCSR Award 2022
  • 2018 - 2022 仮想現実技術と触覚技術を駆使した直感的な生体分子可視化・操作システムの実装
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論文 (22件):
  • Lin Zhang, Hafumi Nishi, Kengo Kinoshita. Multi-Omics Profiling Reveals Phenotypic and Functional Heterogeneity of Neutrophils in COVID-19. International Journal of Molecular Sciences. 2024. 25. 7. 3841-3841
  • Lin Zhang, Hafumi Nishi, Kengo Kinoshita. Single-cell RNA-seq public data reveal the gene regulatory network landscape of respiratory epithelial and peripheral immune cells in COVID-19 patients. Frontiers in Immunology. 2023. 14
  • Tomoyuki Ito, Thuy Duong Nguyen, Yutaka Saito, Yoichi Kurumida, Hikaru Nakazawa, Sakiya Kawada, Hafumi Nishi, Koji Tsuda, Tomoshi Kameda, Mitsuo Umetsu. Selection of target-binding proteins from the information of weakly enriched phage display libraries by deep sequencing and machine learning. mAbs. 2023. 15. 1. 2168470-2168470
  • Wataru Hirose, Makoto Horiuchi, Donghan Li, Ikuko N Motoike, Lin Zhang, Hafumi Nishi, Yusuke Taniyama, Takashi Kamei, Mikiko Suzuki, Kengo Kinoshita, et al. Selective Elimination of NRF2-Activated Cells by Competition with Neighboring Cells in the Esophageal Epithelium. Cellular and molecular gastroenterology and hepatology. 2022. 15. 1. 153-178
  • Lin Zhang, Hafumi Nishi. Transcriptome analysis of Homo sapiens and Mus musculus reveals mechanisms of CD8+ T cell exhaustion caused by different factors. PloS one. 2022. 17. 9. e0274494
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学歴 (4件):
  • 2020 - 2023 University of the People Bachelor of Science in Computer Science, summa cum laude
  • 2004 - 2009 東京工業大学 大学院生命理工学研究科 生体システム専攻
  • 2001 - 2004 東京工業大学 生命理工学部 生命科学科
  • 2000 - 2001 東京工業大学 工学部 第6類
学位 (1件):
  • 博士(理学) (東京工業大学)
経歴 (8件):
  • 2020/02 - 現在 お茶の水女子大学 基幹研究院 准教授(クロスアポイントメント)
  • 2018/09 - 現在 東北大学 大学院情報科学研究科 准教授
  • 2014/08 - 2018/08 東北大学 大学院情報科学研究科 助教
  • 2013/04 - 2014/07 独立行政法人日本学術振興会 特別研究員(PD)
  • 2013/01 - 2013/03 横浜市立大学 大学院生命ナノシステム科学研究科 特任助教
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