- 2023 - 2028 生業動態からみた擦文文化の分布拡大要因
- 2022 - 2026 宗谷海峡域における新石器/縄文時代生活史の実態解明
- 2021 - 2025 日本列島における現生人類移住初期の環境適応史研究
- 2020 - 2025 総括班
- 2020 - 2025 土器の年代と使用法の化学的解明
- 2019 - 2025 ユーラシアにおける土器出現の生態史
- 2021 - 2024 瀬戸内海島嶼部最古の縄文遺跡とその環境に関する総合的研究
- 2019 - 2024 中央アジア 天山-パミール地域における後期旧石器文化成立過程の研究
- 2019 - 2022 東日本における弥生時代以降の栽培植物の波及
- 2019 - 2022 東アジア起源の雑穀(キビ・アワ)の黒海北側ステップ地帯への拡散の時期と経路
- 2016 - 2019 東日本における食糧生産の開始と展開の研究-レプリカ法を中心として-
- 2016 - 2019 レプリカ法によるウクライナ新石器~金石併用時代の栽培穀物の検出と出現期の解明
- 2015 - 2019 本州島東北部における弥生・続縄文時代以降の食性復元
- 2013 - 2017 マリタ遺跡のヴィーナス像に関する年代研究
- 2011 - 2016 擦文文化期における環オホーツク海地域の交流と社会変動
- 2011 - 2016 環日本海北回廊の考古学的研究
- 2011 - 2015 環日本海地域における文化集団の食性変遷に関する研究
- 2010 - 2014 完新世の気候変動と縄紋文化の変化
- 2008 - 2012 ユーラシア北東部における後期旧石器時代人の適応行動に関する総合的研究
- 2011 - 2011 縄文時代におけるクッキー状炭化物の研究II
- 2010 - 2010 三内丸山遺跡の盛土の形成過程とその場所性の解明
- 2010 - 2010 縄文時代におけるクッキー状炭化物の研究
- 2007 - 2010 東北アジアにおける定着的食料採集社会の形成および変容過程の研究
- 2007 - 2010 北東アジア史からみた中世アイヌ文化形成過程の考古学的研究
- 2007 - 2008 東北アジア地域における炭素14年代の列島間比較と環境史
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