研究者
J-GLOBAL ID:202001012356271925   更新日: 2024年07月24日

谷口 雄一

タニグチ ユウイチ | Taniguchi Yuichi
所属機関・部署:
職名: 教授
その他の所属(所属・部署名・職名) (2件):
  • 京都大学  大学院生命科学研究科   教授
  • 大阪大学  大学院生命機能研究科   招へい教授
研究キーワード (11件): 生物物理学 ,  システム生物学 ,  ゲノム ,  スーパーコンピューティング ,  顕微鏡工学 ,  分子動力学計算 ,  機械学習 ,  1分子・1細胞生物学 ,  リソグラフィー ,  次世代シーケンシング ,  プロテオーム
競争的資金等の研究課題 (11件):
  • 2023 - 2029 物理・情報理論を駆使したゲノム高次分子構造解析技術の開発
  • 2021 - 2026 ゲノムを対象とした新規の構造生物学分野の創生
  • 2020 - 2025 ヌクレオソーム動態のモダリティ
  • 2020 - 2025 ゲノム高次分子構造の生物物理学
  • 2020 - 2023 1分子スケール蛍光分析化学の創出
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論文 (26件):
  • Sooyeon Kim, Latiefa Kamarulzaman, Yuichi Taniguchi. Recent methodological advances towards single-cell proteomics. Proceedings of the Japan Academy, Series B. 2023. 99. 8. 306-327
  • Mehrdad Oveisi, Manu Shukla, Nogayhan Seymen, Masae Ohno, Yuichi Taniguchi, Sunil Nahata, Remco Loos, Ghulam J Mufti, Robin C Allshire, Stefan Dimitrov, et al. iNucs: inter-nucleosome interactions. Bioinformatics. 2021. 37. 23. 4562-4563
  • Masae Ohno, Tadashi Ando, David Priest, Yuichi Taniguchi. Hi-CO: 3D genome structure analysis with nucleosome resolution. Nature Protocols. 2021. 16. 3439-3469
  • Soya Shinkai, Masaki Nakagawa, Takeshi Sugawara, Yuichi Togashi, Hiroshi Ochiai, Ryuichiro Nakato, Yuichi Taniguchi, Shuichi Onami. PHi-C: deciphering Hi-C data into polymer dynamics. NAR Genomics and Bioinformatics. 2020. 2. 2. lqaa020
  • Vipin Kumar, Simon Leclerc, Yuichi Taniguchi. BHi-Cect: a top-down algorithm for identifying the multi-scale hierarchical structure of chromosomes. Nucleic Acids Research. 2020. 48. 5. e26-e26
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MISC (2件):
  • 谷口雄一. 1分子・1細胞網羅的遺伝子発現解析. Protein Community. 2011. 7. 16-19
  • Toshio Yanagida, Jim Kozuka, Takuya Okada, Yuichi Taniguchi, Mitsuhiro Iwaki, Yoshiharu Ishii. Chapter 1 Single molecule nano-bioscience: Fluctuations and adaptive biological molecular machines. Handai Nanophotonics. 2007. 3. 3-21
特許 (4件):
  • 顕微鏡、焦準器具、及び試料台保持器具
  • Methods and systems for single-molecule RNA expression profiling
  • データ解析装置、プログラム及び記録媒体、並びにデータ解析方法
  • 分光分析装置、分光分析方法、プログラム、記録媒体及び顕微鏡
書籍 (14件):
  • Single-Molecule Science
    Cambridge University Press 2022 ISBN:9781108525909
  • 細胞 2020年11月号 単一細胞レベル解析の新技術
    ニュー・サイエンス社 2020
  • Minorities and small numbers from molecules to organisms in biology : toward a new understanding of biological phenomena
    Springer 2018 ISBN:9789811320828
  • 定量生物学 : 生命現象を定量的に理解するために
    化学同人 2018 ISBN:9784759817300
  • シングルセル解析プロトコール : わかる!使える!1細胞特有の実験のコツから最新の応用まで
    羊土社 2017 ISBN:9784758122344
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講演・口頭発表等 (83件):
  • Nucleosome-level 3D organization of the genome
    (16th International Symposium on Nanomedicine (ISNM2023) 2023)
  • ヌクレオソーム分解能での ゲノムの3次元構造解析
    (第2回Philosophy研究会 2023)
  • 分子解像度での生命理解に向けて
    (第7回IPRフロンティアセミナー 2023)
  • ゲノムDNAの3次元構造解析技術の開発
    (第15回中谷賞授賞式・受賞講演 2023)
  • 3次元1分子蛍光イメージング技術の開発
    (第5回晝馬輝夫光科学賞授賞式・受賞講演 2023)
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学歴 (3件):
  • 2003 - 2006 大阪大学 大学院基礎工学研究科 機能創成専攻
  • 2001 - 2003 大阪大学 大学院基礎工学研究科 システム人間系専攻
  • 1997 - 2001 大阪大学 基礎工学部 システム科学科
経歴 (12件):
  • 2020/10 - 現在 大阪大学 大学院生命機能研究科 招へい教授
  • 2020/10 - 現在 京都大学 大学院生命科学研究科 教授
  • 2020/10 - 現在 京都大学 高等研究院 教授
  • 2023/10 - 2029/03 科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業CREST 研究代表者
  • 2021/04 - 2026/03 サントリーSunRiSE 生命科学研究者支援プログラム SunRiSEフェロー
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委員歴 (2件):
  • 2016/04 - 現在 日本生物物理学会 分野別専門委員
  • 2024/04 - 2026/03 日本生物物理学会 会誌編集委員
受賞 (10件):
  • 2024 - 第56回市村学術賞奨励賞
  • 2023 - 第15回中谷賞奨励賞
  • 2023 - 第5回晝馬輝夫 光科学賞
  • 2022 - 令和4年度科学技術分野の文部科学大臣表彰 科学技術賞
  • 2022 - 第9回京都SMI中辻賞
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所属学会 (1件):
日本生物物理学会
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