- 2023 - 2027 保全ゲノミクス手法を用いた森林共生モデルの確立と実践:コアラとユーカリの関係から
- 2023 - 2026 消化管共生ネットワークを基盤とする草食性希少野生鳥類の新規保全モダリティの構築
- 2022 - 2025 「海のパンダ」アオウミガメの「腸」能力の解明と利活用
- 2022 - 2025 超有機体の移送に関わる危機意識-雷鳥の野生復帰が生息域微生物相に及ぼす影響評価
- 2024 - 2025 DNA解析によるヤマアラシの種判別
- 2019 - 2023 腸内細菌による野生大型類人猿の消化能力
- 2019 - 2023 霊長類の味覚受容体と消化管共生細菌の共進化:多種共存機構再考の新しいアプローチ
- 2019 - 2022 ニホンライチョウ寄生原虫の寒冷地共生進化経路の解明と保全に向けた実践的病態解明
- 2019 - 2022 ライチョウの再導入に必要な腸内環境整備に関わる技術開発
- 2018 - 2021 スカベンジャー動物アフリカハゲコウの超生存能力を支える腸内細菌とその応用可能性
- 2018 - 2021 野生復帰個体の創出を目標とした「新規採食エンリッチメント」の開発と実践
- 2015 - 2018 おなかエンリッチメント-希少動物の福祉と増殖管理のためのプロバイオ開発
- 2013 - 2016 宿主との共進化をメルクマールとした家畜用プロバイオティクスの選抜と機能開発
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