研究者
J-GLOBAL ID:202001017357793641   更新日: 2024年03月19日

西川 洋平

ニシカワ ヨウヘイ | Nishikawa Yohei
所属機関・部署:
職名: 研究員
その他の所属(所属・部署名・職名) (1件):
研究分野 (1件): 応用微生物学
研究キーワード (5件): マイクロフルイディクス ,  ウイルス ,  環境微生物 ,  ゲノム解析 ,  シングルセル
競争的資金等の研究課題 (10件):
  • 2023 - 2026 キャリアとなる細菌・ウイルスに着目した下水処理工程における薬剤耐性遺伝子の動態
  • 2023 - 2026 一細胞ドロップレット技術による難培養性抗酸菌/薬剤耐性菌のpathogenomics解析
  • 2023 - 2025 根圏ウイルスの機能解析に向けた微量土壌からのウイルス1粒子ゲノム解析技術の開発
  • 2022 - 2025 日本海溝乱泥流物質供給システムと超深海・海底下微生物生態系との広域時空相関の解明
  • 2020 - 2025 土壌微生物叢アトラスに基づいた環境制御による循環型協生農業プラットフォーム構築
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論文 (30件):
  • Kana Jitsuno, Tatsuhiko Hoshino, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Katsuhiko Mineta, Michael Strasser, Ken Ikehara, Jeremy Everes, Lena Maeda, Fumio Inagaki, et al. Comparative single-cell genomics of Atribacterota JS1 in the Japan Trench hadal sedimentary biosphere. mSphere. 2024
  • Masahito Hosokawa, Yohei Nishikawa. Tools for microbial single-cell genomics for obtaining uncultured microbial genomes. 2023
  • Hiroshi Arai, Hisashi Anbutsu, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Kazuo Ishii, Masahito Hosokawa, Shiou-Ruei Lin, Masatoshi Ueda, Madoka Nakai, Yasuhisa Kunimi, et al. Combined actions of bacteriophage-encoded genes in Wolbachia-induced male lethality. iScience. 2023. 26. 6. 106842-106842
  • Masato Kogawa, Yohei Nishikawa, Tatsuya Saeki, Takuya Yoda, Koji Arikawa, Haruko Takeyama, Masahito Hosokawa. Revealing within-species diversity in uncultured human gut bacteria with single-cell long-read sequencing. Frontiers in Microbiology. 2023. 14. 1133917-1133917
  • Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Toru Maruyama, Yuko Tsukada, Masato Kogawa, Hiroki Takeda, Haruka Ito, Ryota Wagatsuma, Rimi Miyaoka, Yoshikatsu Nakano, et al. Targeted single-cell genomics reveals novel host adaptation strategies of the symbiotic bacteria Endozoicomonas in Acropora tenuis coral. Microbiome. 2022. 10. 1. 220-220
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MISC (5件):
  • 星野 仁彦, 吉田 光範, 西川 洋平, 鈴木 仁人, 深野 華子, 竹山 春子, 鈴木 敏彦. 微生物群集の構造と動態の理解 シングルセルゲノミクスによる環境微生物相の分布調査(Understanding microbial community structures and dynamics A distribution survey of environmental microbiome by single-cell genomics). 日本細菌学雑誌. 2022. 77. 1. 17-17
  • 細川 正人, 西川 洋平, 竹山 春子. 難培養微生物を対象としたシングルセルゲノミクスの課題と展望 (特集 細菌叢解析の光と影) -- (ゲノム進化・メタゲノム). 生体の科学. 2017. 68. 2. 150-154
  • 細川 正人, 西川 洋平, 竹山 春子. ドロップレット・マイクロフルイディクスによる超並列シングルセル解析. Chemical sensors = 化学センサ. 2016. 32. 4. 159-165
  • 宮岡 理美, モリ テツシ, 細川 正人, 安藤 正浩, 小川 雅人, 西川 洋平, 浜口 宏夫, Piel Jorn, 竹山 春子. 1P-257 顕微ラマン分光法を用いた海洋カイメンTheonella swinhoeiからの生理活性物質生産菌体の同定(バイオセンシング,分析化学,一般講演). 日本生物工学会大会講演要旨集. 2015. 67. 153-153
  • 細川 正人, 西川 洋平, 小川 雅人, 竹山 春子. 1P-256 微小液滴を用いた単一細胞の超並列ゲノム増幅法の開発(バイオセンシング,分析化学,一般講演). 日本生物工学会大会講演要旨集. 2015. 67. 152-152
書籍 (4件):
  • 海の生物と環境をどう守るか
    西日本出版社 2022 ISBN:9784908443442
  • シングルセル解析の新たな可能性
    北隆館 2021
  • 環境細菌のシングルセルゲノム解析 : 微小液滴を用いたゲノム解析手法とその応用例
    2020
  • バイオイノベーションに向けて : バイオテクノロジーの新技術からの新しい視点
    シーエムシー出版 2019 ISBN:9784781314112
講演・口頭発表等 (49件):
  • Single-virus genomics of environmental DNA viruses reveals genomic micro-diversities
    (UQ-Waseda University Joint Symposium 2024)
  • 土壌微生物叢アトラスに基づいた環境制御による循環型協生農業プラットフォーム構築
    (ムーンショット早稲田デー「わが国の破壊的イノベーションを先導するためには何をすべきか?」 2024)
  • 環境細菌・ファージの機能解明に向けた 1細胞・1粒子ゲノム解析技術の開発と応用
    (日本微生物生態学会第36回浜松大会 2023)
  • 微生物・ウイルスを対象としたシングルセルゲノム解析
    (BioJapan2023 2023)
  • Comprehensive Analysis of Phage Diversity in Suruga Bay, Japan, through droplet-based Single-Virus Genomics
    (13th Asia Pacific Marine Biotechnology Conference (APMBC) 2023)
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学位 (1件):
  • 工学 (Engineering) (早稲田大学)
経歴 (4件):
  • 2022/10 - 現在 国立研究開発法人産業技術総合研究所 産総研・早大 CBBD-OIL 研究員
  • 2021/04 - 現在 早稲田大学 ナノ・ライフ創新研究機構 次席研究員
  • 2019/04 - 2021/03 国立研究開発法人産業技術総合研究所 産総研・早大 生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ
  • 2016/04 - 2019/03 独立行政法人日本学術振興会
受賞 (1件):
  • 2016/09 - 日本生物工学会 第5回生物工学学生優秀賞(飛翔賞) マイクロドロップレットによる単一微生物からの効率的な全ゲノム増幅法の開発
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