研究者
J-GLOBAL ID：202001021253431524   更新日: 2024年07月25日

沖本 憲明

Okimoto Noriaki
競争的資金等の研究課題 (2件)：
  • 2009 - 2010 計算機支援による合理的な薬剤最適化手法の開発
  • 2005 - 2006 タンパク質の揺らぎ及び溶媒効果を考慮した分子動力学計算の薬剤設計への応用
論文 (5件)：
  • Teruhisa S. Komatsu, Noriaki Okimoto, Yohei M. Koyama, Yoshinori Hirano, Gentaro Morimoto, Yousuke Ohno, Makoto Taiji. Drug binding dynamics of the dimeric SARS-CoV-2 main protease, determined by molecular dynamics simulation. SCIENTIFIC REPORTS. 2020. 10. 1
  • Elvira Tarasova, Vladimir Farafonov, Reza Khayat, Noriaki Okimoto, Teruhisa S. Komatsu, Makoto Taiji, Dmitry Nerukh. All-Atom Molecular Dynamics Simulations of Entire Virus Capsid Reveal the Role of Ion Distribution in Capsid's Stability. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY LETTERS. 2017. 8. 4. 779-784
  • Yoko Aida, Jiyun Kim, Noriaki Okimoto, Junya Yamagishi, Seiichi Tada, Yoshihiro Ito, Shin-nosuke Takeshima. A novel bovine leukemia virus peptide vaccine targeting susceptible cattle-Production by 3-D modelling and nanotechnology. RETROVIROLOGY. 2015. 12
  • Junya Yamagishi, Noriaki Okimoto, Takuma Kasai, Atsushi Suenaga, Mariko Okada, Akira Imamoto, Makoto Taiji. Computational design of small peptide inhibitors of protein-protein interactions in CRK-SH2 mediated intracellular signaling. Models in Bioscience and Materials Research: Molecular Dynamics and Related Techniques. 2013. 155-166
  • Tetsu Narumi, Makoto Taiji, Mitsuru Ikei, Yousuke Ohno, Noriaki Okimoto, Takahiro Koishi, Atsushi Suenaga, Noriyuki Futatsugi, Ryoko Yanai, Ryutaro Himeno, et al. Gordon Bell finalists II---A 55 TFLOPS simulation of amyloid-forming peptides from yeast prion Sup35 with the special-purpose computer system MDGRAPE-3. 2006
MISC (6件)：
  • 佐藤竜馬, 森義治, 松井理紗, 沖本憲明, 山元淳平, 泰地真弘人. DASH型クリプトクロムのDNA修復機能発現に関する理論的考察. 生物物理(Web). 2022. 62. 2
  • 間 陽子, 金 智潤, 蛇島 武久, He Pan, 多田 誠一, 伊藤 嘉浩, 山岸 純也, 沖本 憲明, 的場 和弘, 竹嶋 伸之輔. インシリコおよびナノ技術を駆使した牛白血病ペプチドワクチンの創製. 日本獣医学会学術集会講演要旨集. 2014. 157回. 425-425
  • 竹嶋 伸之輔, 松本 有生, Giovambattista Guillermo, 山岸 純也, 沖本 憲明, Arainga-Ramirez Mariluz, 宮坂 卓, 間 陽子. 主成分分析および立体構造解析によるMHCの多様性に基づくウシMHCクラスII分子の機能予測. MHC: Major Histocompatibility Complex. 2011. 18. 2. 160-160
  • 金 智潤, 竹嶋 伸之輔, 沖本 憲明, 山岸 純也, 堂前 直, 萩原 恭二, 間 陽子. 牛白血病ウイルス感受性ウシMHCクラスII分子から得られた抗原ペプチドの同定および結合親和力解析. MHC: Major Histocompatibility Complex. 2011. 18. 2. 136-136
  • 沖本憲明, 泰地真弘人. 計算機で生命システムをモデリング・設計する 1.コンピュータでタンパク質,薬を設計する. 実験医学. 2011. 29. 7
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講演・口頭発表等 (21件)：
  • リガンド結合に伴うタンパク質結合ポケット変化の分子動力学的研究
    (分子シミュレーション討論会講演要旨集 2019)
  • 量子化学計算による薬物分子の代謝反応性部位と初期反応過程に関する考察
    (分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 2019)
  • 分子シミュレーションを用いたシトクロムP450(CYP)に対する薬物代謝部位予測
    (分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 2018)
  • 分子シミュレーションを用いたシトクロムP450(CYP)に対する薬物代謝部位予測
    (分子シミュレーション討論会講演要旨集 2017)
  • 計算創薬研究における薬物結合ポケットの柔軟性に関する研究
    (分子シミュレーション討論会講演要旨集 2017)
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