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J-GLOBAL ID：202002210309817249   整理番号：20A1271207

骨肉腫における病原性遺伝子と転写因子の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Pathogenic Genes and Transcription Factors in Osteosarcoma

著者 (12件)： Yang Chenggang (Gu’an Bojian Bio-Technology Co., LTD, Langfang, China) ,  Yang Chenggang (Department of BigData, Beijing Medintell Bioinformatic Technology Co., LTD, Beijing, China) ,  Huang Di (Gu’an Bojian Bio-Technology Co., LTD, Langfang, China) ,  Huang Di (Department of BigData, Beijing Medintell Bioinformatic Technology Co., LTD, Beijing, China) ,  Ma Cui (Gu’an Bojian Bio-Technology Co., LTD, Langfang, China) ,  Ma Cui (Department of BigData, Beijing Medintell Bioinformatic Technology Co., LTD, Beijing, China) ,  Ren Jing (Department of BigData, Beijing Medintell Bioinformatic Technology Co., LTD, Beijing, China) ,  Fu Lina (Department of BigData, Beijing Medintell Bioinformatic Technology Co., LTD, Beijing, China) ,  Cheng Cheng (Department of BigData, Beijing Medintell Bioinformatic Technology Co., LTD, Beijing, China) ,  Li Bangling (School of biotechnology, Jiangnan University, Wuxi, China) ,  Shi Xiaofeng (Gu’an Bojian Bio-Technology Co., LTD, Langfang, China) ,  Shi Xiaofeng (Department of BigData, Beijing Medintell Bioinformatic Technology Co., LTD, Beijing, China)
資料名： Pathology & Oncology Research  (Pathology & Oncology Research)
巻： 26  号： 2  ページ： 1041-1048  発行年： 2020年 
JST資料番号： W4831A  ISSN： 1219-4956  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 骨肉腫(OS)は骨の悪性腫瘍である。本研究は,OSの潜在的病原性遺伝子と上流調節因子を同定し,分析することを意図した。著者らは,3つの遺伝子発現Omnibus(GEO)データベース(GSE66673,GSE49003,およびGSE37552)を用いて,OSの候補病原性遺伝子を同定するための統合分析を行った。GOとKEGG濃縮分析を用いて,差別的に発現した遺伝子(DEG)の機能的アノテーションと潜在的経路を予測した。OS特異的転写調節ネットワークを確立し,OSにおけるDEGを標的とする重要な転写因子(TF)を研究した。3つのGEOデータセットから,転移OSサンプルと非転移OSサンプルの間の759のDEGを同定した。GOおよびKEGG分析の後,細胞接着(FDR=1.27E-08),蛋白質結合(FDR=1.13E-22),細胞質(FDR=5.63E-32)および破骨細胞分化(FDR=0.000992221)は,DEGに対して有意に濃縮された経路であった。HSP90AA1は最も高い程度(32)を示し,癌の経路とシグナル伝達に富んでいた。Pax-6により調節されたBMP6は,TGF-βシグナル伝達経路に富んでいた。BMP6は非転移OS試料でPax-6によりダウンレギュレートされることを示した。上方制御されたHSP90AA1と下方制御されたBMP6および癌の経路とシグナル伝達の経路は,OSの病因に関与していると推論された。OSにおける同定されたバイオマーカーと生物学的プロセスは更なる研究の基礎を提供する可能性がある。Copyright Aranyi Lajos Foundation 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *遺伝子 ,  細胞接着 ,  *骨肉腫 ,  遺伝子発現 ,  細胞情報伝達 ,  ダウンレギュレーション ,  *転写因子 ,  バイオマーカー ,  病因 ,  アノテーション
準シソーラス用語： 悪性腫瘍 ,  調節因子 ,  破骨細胞形成 ,  KEGG , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 骨肉腫 ,  転写因子 ,  DEGS ,  統合分析

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 骨肉腫 ,  病原性遺伝子 ,  転写因子 ,  同定