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J-GLOBAL ID：202002210746088862   整理番号：20A2396393

統合解析による心房細動における環状RNA-MicroRNA-Messenger RNA調節ネットワークの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Circular RNA-MicroRNA-Messenger RNA Regulatory Network in Atrial Fibrillation by Integrated Analysis

著者 (7件)： Liu Tao (Department of Cardiology, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang 050000, China) ,  Zhang Guoru (Department of Cardiology, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang 050000, China) ,  Wang Yaling (Department of Cardiology, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang 050000, China) ,  Rao Mingyue (Department of Cardiology, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang 050000, China) ,  Zhang Yang (Department of Cardiology, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang 050000, China) ,  Guo Anjun (Department of Cardiology, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang 050000, China) ,  Wang Mei (Department of Cardiology, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang 050000, China)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2020  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景.円形RNA(循環RNA)は閉ループ構造を形成する非コードRNAであり,その異常発現は疾患を引き起こす可能性がある。心房細動(AF)におけるサーコRNA関連競合内因性RNA(ceRNA)の潜在的ネットワークを見つけることを目的とした。方法.AF患者からの心臓組織の循環RNA,miRNA,およびmRNA発現プロフィールを,遺伝子発現Omnibusデータベースから検索し,包括的に分析した。特異的に発現したサーコRNA(DEcirRNAs),特異的に発現したmiRNA(DEmiRNAs),および差次的に発現したmRNA(DEmRNAs)を同定し,続いてDEcircRNA-DEmiRNA-DEmRNA調節ネットワークの確立を行った。ceRNA調節ネットワークにおけるDEcirRNAsとDEmRNAsの宿主遺伝子の機能アノテーション解析を行った。in vitro実験および電子検証を用いて,DE循環RNA,DEmiRNAおよびDEmRNAの発現を検証した。【結果】合計1611のDEcircRNA,51のDEmiRNA,および1250のDEmRNAをAFにおいて同定した。DEcircRNA-DEmiRNA-DEmRNAネットワークは,62のサーコRNA,14のmiRNAと728のmRNAを含んだ。その中で,hsa-circRNA-100053-hsa-miR-455-5p-TRPV1とhsa-circRNA-005843-hsa-miR-188-5p-SPON1の2つのceRNA調節対を同定した。さらに,hsa-miR-34c-5p-INMT,hsa-miR-1253-DDIT4L,hsa-miR-508-5p-SMOC2,hsa-miR-943-ACTA1,hsa-miR-338-3p-WIPI1およびhsa-miR-199a-3p-RAP1GAP2を含む6つのmiRNA-mRNA調節対も得た。MTORはDEcirRNAの宿主遺伝子の著しく豊富なシグナル伝達経路であった。加えて,不整脈原性右心室心筋症,拡張型心筋症,および肥大型心筋症は,DEcircRNA-DEmiRNA-DEmRNA調節ネットワークにおけるDEmRNAの著しく豊富なシグナル伝達経路であった。hsa-circRNA-402565,hsa-miR-34c-5p,hsa-miR-188-5p,SPON1,DDIT4L,SMOC2,およびWIPI1の発現検証は統合分析と一致した。結論.著者らは,hsa-circRNA-100053-hsa-miR-455-5p-TRPV1とhsa-circRNA-005843-hsa-miR-188-5p-SPON1相互作用対がAFに関与する可能性があると推測した。Copyright 2020 Tao Liu et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  データベース ,  *ネットワーク ,  心臓 ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝子 ,  *心房細動 ,  遺伝子発現 ,  in vitro実験 ,  拡張型心筋症 ,  アノテーション
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  内因性 ,  *遺伝子調節ネットワーク , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (63件)：

• D. J. Graham, M. E. Reichman, M. Wernecke, R. Zhang, M. R. Southworth, M. Levenson, T. C. Sheu, K. Mott, M. R. Goulding, M. Houstoun, T. E. MaCurdy, C. Worrall, J. A. Kelman, "Cardiovascular, bleeding, and mortality risks in elderly Medicare patients treated with dabigatran or warfarin for nonvalvular atrial fibrillation," Circulation, vol. 131, no. 2, pp. 157-164, 2015.
• N. F. Marrouche, J. Brachmann, D. Andresen, J. Siebels, L. Boersma, L. Jordaens, B. Merkely, E. Pokushalov, P. Sanders, J. Proff, H. Schunkert, H. Christ, J. Vogt, D. Bänsch, CASTLE-AF Investigators, "Catheter ablation for atrial fibrillation with heart failure," New England Journal of Medicine, vol. 378, no. 5, pp. 417-427, 2018.
• K. Lang, D. Bozkaya, A. A. Patel, B. Macomson, W. Nelson, G. Owens, S. Mody, J. Schein, J. Menzin, "Anticoagulant use for the prevention of stroke in patients with atrial fibrillation: findings from a multi-payer analysis," Bmc Health Services Research, vol. 14, no. 1, pp. 329, 2014.
• S. Jiang, C. Guo, W. Zhang, W. Che, J. Zhang, S. Zhuang, Y. Wang, Y. Zhang, B. Liu, "The integrative regulatory network of circRNA, microRNA, and mRNA in atrial fibrillation," Frontiers in Genetics, vol. 10, pp. 526, 2019.
• N. Dagres, M. Anastasiou-Nana, "Atrial fibrillation and obesity: an association of increasing importance," Journal of the American College of Cardiology, vol. 55, no. 21, pp. 2328-2329, 2010.

タイトルに関連する用語 (7件)： 統合解析 ,  心房細動 ,  環状RNA ,  microRNA ,  RNA ,  調節ネットワーク ,  同定