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J-GLOBAL ID：202002211029513007   整理番号：20A1208109

Trichophyton violaceumにおけるパルブアルブミン様蛋白質の同定と特性化【JST・京大機械翻訳】

Identification and characterization of parvalbumin-like protein in Trichophyton violaceum

著者 (4件)： Zolfaghari Emameh Reza (Department of Energy and Environmental Biotechnology, National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology (NIGEB), 14965/161, Tehran, Iran) ,  Masoori Leila (Department of Laboratory Sciences, Lorestan University of Medical Sciences, Khorramabad, Iran) ,  Taheri Ramezan Ali (Nanobiotechnology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran) ,  Falak Reza (Immunology Research Center, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran)
資料名： Fungal Biology  (Fungal Biology)
巻： 124  号： 6  ページ： 592-600  発行年： 2020年 
JST資料番号： D0107B  ISSN： 1878-6146  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： パルブアルブミンは,細胞周期,ニューロンの発生,筋肉の収縮および細胞内カルシウムの調節のような脊椎動物の神経筋系において重要な生理学的役割を果たす。これらの神経筋機能を実行するために,パルブアルブミンはカルビンジン,炭酸アンヒドラーゼ,およびチトクロームオキシダーゼを含む他の蛋白質と関連している可能性がある。ヒトは,いくつかの異なる魚種の消費後にパルブアルブミンに対するIgE特異的過敏症を示す可能性がある。この蛋白質は魚類筋肉に豊富に存在するが,魚類パルブアルブミンに関連する文献の文献レビューは真核生物におけるパルブアルブミンの存在を指摘していない。本研究では,いくつかの非魚種において,遠縁に関連するパルバルミンが見出される可能性があることを提案する。多重配列アラインメント(MSA),系統発生解析および分子ベース実験のような生物情報学研究は,EFハンドドメインおよびCa2+結合部位を有する少なくとも2つのパルブアルブミン配列(UniProt ID:A0A178F775およびA0A178F7E4)が病原性真菌種Trichophyton violaceumで同定できることを示す。両遺伝子は単一エキソンから成り,保存されたアミノ酸モチーフを持つパルブアルブミン蛋白質にコードされていることが決定された。抗原性予測は,最初のEFハンドドメインのCa2+結合部位の両側に位置する抗原部位を明らかにした。著者らの系統発生分析は,パルバリンミン(UniProt ID:0A178F775)の1つがT.violaceum(UniProt ID:A0A178F7E4)と魚種において進化現象を通して他のパルバルミンに進化できることを明らかにした。著者らのin silico発見を確認するために,ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によりT.violaceumパルブアルブミン(UniProt ID:A0A178F7E4)の1つを検出するために3つのプライマー対を設計した。1つのプライマー対はアガロースゲル電気泳動において強い特異的バンドを示した。この方法の特異性を評価するために,プライマーをTrichophyton rubrumおよびT.mentagrophytesから抽出したDNAについて試験した。結果は,評価パルブアルブミン遺伝子(UniProt ID:A0A178F7E4)がT.violaceum特異的であり,この病原性真菌がパルブアルブミン遺伝子の同定を通してT.rubrumとT.mentagrophytesから区別できることを示した。T.violaceumにおけるパルブアルブミンの生化学的および生理学的機能を解明するためにはさらなる研究が必要である。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ニューロン ,  DNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  抗原 ,  ヒト ,  系統発生 ,  結合部位 ,  *白癬菌属 ,  細胞周期 ,  免疫グロブリンE ,  真核生物 ,  *パルブアルブミン ,  PCR法
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  ドメイン構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： バイオインフォマティクス ,  炭酸アンヒドラーゼ ,  真菌進化 ,  水平遺伝子導入(HGT) ,  分子検出 ,  ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)

分類 (1件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： Trichophyton ,  パルブアルブミン ,  蛋白質 ,  同定 ,  特性化