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J-GLOBAL ID：202002211097279867   整理番号：20A0573024

相同低温ショック蛋白質の熱安定性に対する静電気学と折畳み動力学の役割【JST・京大機械翻訳】

The Role of Electrostatics and Folding Kinetics on the Thermostability of Homologous Cold Shock Proteins

著者 (5件)： Ferreira Paulo Henrique Borges (Laboratorio de Biofisica Teorica, Departamento de Fisica, Instituto de Ciencias Exatas, Naturais e Educacao, Universidade Federal do Triangulo Mineiro, Minas Gerais, Brazil) ,  Freitas Frederico Campos (Laboratorio de Biofisica Teorica, Departamento de Fisica, Instituto de Ciencias Exatas, Naturais e Educacao, Universidade Federal do Triangulo Mineiro, Minas Gerais, Brazil) ,  McCully Michelle E. (Department of Biology, Santa Clara University, California, United States) ,  Slade Gabriel Gouvea (Laboratorio de Biofisica Teorica, Departamento de Fisica, Instituto de Ciencias Exatas, Naturais e Educacao, Universidade Federal do Triangulo Mineiro, Minas Gerais, Brazil) ,  de Oliveira Ronaldo Junio (Laboratorio de Biofisica Teorica, Departamento de Fisica, Instituto de Ciencias Exatas, Naturais e Educacao, Universidade Federal do Triangulo Mineiro, Minas Gerais, Brazil)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 60  号： 2  ページ： 546-561  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質の熱安定性に寄与する側面を理解することは,何十年も持続した挑戦であり,それは蛋白質工学に対して大きな関連性がある。いくつかのタイプの相互作用は蛋白質の熱安定性に影響する。それらの中で,静電相互作用が特に注目されている。このタイプの相互作用が蛋白質の熱安定性にどのように影響するかを調べる目的で,本論文では,一連の理論的方法論を用いて好冷性,中温性,好熱性および超好熱性生物からの4つの相同性寒冷ショック蛋白質を調べた。これらの蛋白質の安定化のために,静電学と疎水性が鍵となる要素であることはよく知られている。したがって,両相互作用は各蛋白質の天然構造で最初に分析された。天然構造中に存在する静電相互作用を,溶媒接近性を有するTanford-Kirkwoodモデルにより計算し,折畳みに埋め込まれた疎水性表面積の量を,折畳みおよび拡張構造の両方を測定することにより推定した。エネルギー景観理論に基づいて,局所フラストレーションと単純化α-炭素構造ベースモデルをDebye-Hueckelポテンシャルを用いてモデル化し,静電学と陰的溶媒の効果を考慮した。構造ベースのモデルシミュレーションのための熱力学データを収集し,加重ヒストグラム解析と確率拡散法を用いて解析した。折畳み時間,遷移経路時間,折畳み経路及びΦ値を含む速度論量も得た。結果として,この方法は静電相互作用が最も安定な好熱性低温ショック蛋白質の安定化に重要な役割を果たし,実験データと一致することを示した。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 好冷性 ,  好熱性 ,  相互作用 ,  中温 ,  疎水性 ,  *折畳み ,  *タンパク質 ,  速度論 ,  簡素化 ,  タンパク質工学 ,  熱安定性 ,  静電相互作用 ,  表面積 ,  相同性
準シソーラス用語： 静電気学 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： 低温ショック蛋白質 ,  熱安定性 ,  静電気学 ,  折畳み ,  動力学 ,  役割