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J-GLOBAL ID：202002211689571652   整理番号：20A1413721

SARS-CoV-2の進化的解析:非構造蛋白質6(NSP6)の変異はウイルスオートファジーに影響を及ぼす【JST・京大機械翻訳】

Evolutionary analysis of SARS-CoV-2: how mutation of Non-Structural Protein 6 (NSP6) could affect viral autophagy

著者 (9件)： Benvenuto Domenico (Unit of Medical Statistics and Molecular Epidemiology, University Campus Bio-Medico of Rome, Via Alvaro del Portillo, 21, Rome 00128, Italy) ,  Angeletti Silvia (Unit of Clinical Laboratory Science, University Campus Bio-Medico of Rome, Via Alvaro del Portillo, 21, Rome 00128, Italy) ,  Giovanetti Marta (Laboratorio de Flavivirus, Instituto Oswaldo Cruz, Fundacao Oswaldo Cruz, Av. Brasil, 4365 - Manguinhos, Rio de Janeiro - RJ 21040-900, Brasil) ,  Bianchi Martina (Department of Biochemical Sciences ”A. Rossi Fanelli”, University of Rome “La Sapienza”, Viale Regina Elena, 332, Rome 00185, Italy) ,  Pascarella Stefano (Department of Biochemical Sciences ”A. Rossi Fanelli”, University of Rome “La Sapienza”, Viale Regina Elena, 332, Rome 00185, Italy) ,  Cauda Roberto (UOC Malattie Infettive - Fondazione Policlinico Universitario “A.Gemelli” IRCCS, Largo Agostino Gemelli, 8, Rome 00168, Italy) ,  Cauda Roberto (Department of Healthcare Surveillance and Bioethics, Catholic University of Sacred Heart, Largo Francesco Vito, 1, Rome 00168, Italy) ,  Ciccozzi Massimo (Unit of Medical Statistics and Molecular Epidemiology, University Campus Bio-Medico of Rome, Via Alvaro del Portillo, 21, Rome 00128, Italy) ,  Cassone Antonio (Center of genomics, genetics and biology, University of Siena, Petriccio e Belriguardo, 35, Siena 53100, Italy)
資料名： Journal of Infection  (Journal of Infection)
巻： 81  号： 1  ページ： e24-e27  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3165A  ISSN： 0163-4453  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： SARS-CoV-2は,世界的に広がった新しいコロナウイルスであり,150000以上の人々に感染し,WHOにより流行している。ここでは,ゲノム構造変異のマッピングと選択のパターンで,そのゲノムの351の利用可能な配列の生体情報,進化解析を提供した。最大尤度ツリーを構築し,感染の臨床進化に潜在的に影響するSARS-CoV-2流行中に発生する変異を見出すために,選択的圧力を調べた。より最近の分離株において,非構造蛋白質6(NSP6)およびOpen Reding Frame10(ORF 10)隣接領域に影響する2つの変異の存在を見出した。アミノ酸変化安定性分析は両変異が蛋白質構造のより低い安定性を与えることを示唆した。2つの突然変異のうちの1つは,ウイルス伝播の間にゲノム内で発達し,ウイルスの細胞内生存に影響を及ぼす可能性がある。ウイルス病原性を有意に修飾できる変異を同定するために,SARS-CoV-2伝播のゲノム追跡が緊急に必要である。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最尤法 ,  定性分析 ,  アミノ酸 ,  突然変異 ,  ゲノム ,  *オートファジー
準シソーラス用語： コロナウイルス ,  *SARSウイルス ,  *重症急性呼吸器症候群 ,  ウイルス伝播 ,  蛋白質構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： SARS-CoV-2 ,  COVID-19 ,  コロナウイルス ,  バイオインフォーマティクス ,  オートファジー ,  分子進化

分類 (1件)： ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (7件)： SARS-CoV-2 ,  進化 ,  解析 ,  構造蛋白質 ,  変異 ,  ウイルス ,  オートファジー