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J-GLOBAL ID：202002211859118810   整理番号：20A2330400

統合トランスクリプトームとホスホプロテオーム分析はfads2が体LC-PUFA恒常性維持に重要であることを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Integrated transcriptome and phosphoproteome analyses reveal that fads2 is critical for maintaining body LC-PUFA homeostasis

著者 (6件)： Zhao Yan (College of Fisheries, Key Lab of Agricultural Animal Genetics, Breeding and Reproduction of Ministry of Education/Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Yang Gang (College of Fisheries, Key Lab of Agricultural Animal Genetics, Breeding and Reproduction of Ministry of Education/Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Wu Ningyuan (College of Fisheries, Key Lab of Agricultural Animal Genetics, Breeding and Reproduction of Ministry of Education/Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Wu Ningyuan (National Demonstration Center for Experimental Aquaculture Education, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Cao Xiaojuan (College of Fisheries, Key Lab of Agricultural Animal Genetics, Breeding and Reproduction of Ministry of Education/Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Gao Jian (College of Fisheries, Key Lab of Agricultural Animal Genetics, Breeding and Reproduction of Ministry of Education/Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China)
資料名： Journal of Proteomics  (Journal of Proteomics)
巻： 229  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0073A  ISSN： 1874-3919  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 脂肪酸デスアラート2(Fads2)は多くの慢性疾患と関連する。それにもかかわらず,その役割に関する包括的な研究は行われていない。ここでは,トランスクリプトミクス,プロテオミクスおよびホスホプロテオミクスによるfads2欠失ゼブラフィッシュ(fads2-/-)の長鎖多価不飽和脂肪酸(LC-PUFA)代謝の統合解析を行った。野生型ゼブラフィッシュ(WT)と比較して,fads2-/-は,肝臓リノール酸(オール-シス-9,12-C18:2),α-リノレン酸(all-cis-9,12,15-C18:3,およびドコサペタエン酸(all-cis-7,10,13,16,19-C22:5)の有意に高い含有量,およびγ-リノレン酸(all-cis-6,9,12-C18:3,ステアリドン酸(オール-シス-6,9,12,15-C18:4)およびドコサヘキサエン酸(オール-シス-4,7,10,13,16,19-C22:6)のより低い含有量を示し,n-6/n-3 PUFAレベルの増加を伴った。全体で,1608の差次的発現遺伝子(DEG),209の差次的発現蛋白質(DEP)および153の差次的発現リン酸化蛋白質(DEPP)を,fads2-/-とWTの間の190部位で特定した。トランスクリプトームおよびプロテオーム分析は,これらDEGおよびDEPをLC-PUFA合成およびPPARシグナリング経路に同時に凝集させた。DEPPsの更なる相互作用ネットワーク分析は,小胞体経路におけるスプライセオソームと蛋白質プロセシングが重要なグループであることを示した。さらに,fads2-/-ゼブラフィッシュにおいて7つの高度にリン酸化されたキナーゼと高度に発現したホスファターゼを測定した。これらの結果は,fads2が代謝性疾患発生に影響を及ぼす機構への洞察を与え,ヒト疾患治療のための標的選択のためのデータセットを提供する。バランスしたLC-PUFA組成は身体健康と深く関連していたが,LC-PUFAの変化は心血管疾患,2型糖尿病および炎症性疾患のような重篤な疾患を通常誘導した。脂肪酸デサチュラーゼ2(Fads2)は脂肪酸デサチュラーゼ蛋白質ファミリーに置換され,LC-PUFA合成における最初の脱飽和反応を触媒する。Fads2は代謝異常,2型糖尿病および肥満を含む多くの慢性疾患と関連するが,その役割に関する包括的研究は行われていない。統合トランスクリプトーム,プロテオームおよびホスホプロテオーム解析に基づき,fads2が体LC-PUFAホメオスタシスの維持に重要であることを確認した。さらに,小胞体経路におけるPPARシグナル伝達経路,スプライスソームおよび蛋白質プロセシングを含む重要な経路,およびLC-PUFA代謝に関連する候補キナーゼ標的を決定した。これらの知見は,ヒト疾患治療に対する標的選択のための機構の解明と可能なデータセットの提供に寄与するであろう。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  脂肪酸 ,  遺伝子 ,  ホスファターゼ ,  リン酸化 ,  ホメオスタシス ,  ゼブラフィッシュ ,  野生型 ,  プロテオミクス ,  *トランスクリプトーム ,  *プロテオーム
準シソーラス用語： *ホスホプロテオーム ,  ホスホプロテオミクス ,  キナーゼ ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： LC-PUFA ,  Fads2 ,  トランスクリプトーム ,  プロテオミクス ,  ホスホプロテオミクス ,  キナーゼ

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 統合 ,  トランスクリプトーム ,  ホスホプロテオーム ,  分析 ,  LC-PUFA ,  恒常性