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J-GLOBAL ID：202002211995906818   整理番号：20A1934069

分子クランプを用いたアプタマー折畳みエネルギーの測定【JST・京大機械翻訳】

Measuring Aptamer Folding Energy Using a Molecular Clamp

著者 (9件)： Qu Hao (School of Food and Biological Engineering, Hefei University of Technology, China) ,  Ma Qihui (School of Food and Biological Engineering, Hefei University of Technology, China) ,  Wang Lu (School of Food and Biological Engineering, Hefei University of Technology, China) ,  Mao Yu (School of Food and Biological Engineering, Hefei University of Technology, China) ,  Eisenstein Michael (Department of Electrical Engineering, Stanford University, California, United States) ,  Eisenstein Michael (Department of Radiology, Stanford University, California, United States) ,  Soh Hyongsok Tom (Department of Electrical Engineering, Stanford University, California, United States) ,  Soh Hyongsok Tom (Department of Radiology, Stanford University, California, United States) ,  Zheng Lei (School of Food and Biological Engineering, Hefei University of Technology, China)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 142  号： 27  ページ： 11743-11749  発行年： 2020年 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 折畳みエネルギー(ΔG_fold)はアプタマーの安定性と機能を特性化するための有用な計量を提供する。しかし,折畳みエネルギーを実験的に測定することは困難であり,このパラメータを直接測定する一般的な技術は存在しない。本研究では,アプタマー折畳みエネルギーを測定する簡単なアプローチを示した。最初に,アプタマーはアプタマー末端に結合した二本鎖DNA「分子クランプ」と平衡条件下で伸長した。次に,時間分解ゲル電気泳動を用いてストレスDNA分子の全内部エネルギーを測定し,アプタマー折畳みエネルギーを誘導するために,アプタマーまたは非構造化ランダム一本鎖DNAのどちらかを組み込んだ分子クランプストレス分子の折畳みおよびアンフォールディング挙動を比較した。このアプローチを用いて,HD22トロンビンアプタマーに対して10.40kJ/molの折畳みエネルギーを測定し,これは他の予測と推定と一致した。また,簡単なヘアピン構造を解析し,9.05kJ/molの折畳みエネルギー結果を生成し,計算モデル(9.24kJ/mol)によって予測された値と一致した。本戦略は,実質的に任意のアプタマーでそのような測定を得るためのアクセス可能な一般的アプローチを提供すると信じる。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クランプ ,  ゲル電気泳動 ,  DNA【核酸】 ,  デコンボリューション ,  *折畳み ,  ヘアピン構造 ,  内部エネルギー ,  キャラクタリゼーション ,  一本鎖DNA ,  計算モデル
準シソーラス用語： *アプタマー ,  二本鎖DNA , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (5件)： 分子 ,  クランプ ,  アプタマー ,  折畳み ,  エネルギー