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J-GLOBAL ID：202002212172286090   整理番号：20A0940513

百子蓮胚性カルスの超低温過程におけるプロテオミクス研究【JST・京大機械翻訳】

Proteomics analysis of embryogenic callus of Agapanthus praecox during cryopreservation

著者 (2件)： Lv Shan (上海交通大学設計学院園林科学与工程系,上海,200240) ,  Zhang Di (上海交通大学設計学院園林科学与工程系,上海,200240)
資料名： Nanfang Nongye Xuebao  (Nanfang Nongye Xuebao)
巻： 50  号： 11  ページ： 2410-2420  発行年： 2019年 
JST資料番号： C2960A  ISSN： 2095-1191  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]プロテオミクスの面から、植物胚性細胞の超低温保存複合逆境に対する応答調節メカニズムを明らかにし、百子蓮胚性カルスの超低温保存における差異発現タンパク質をスクリーニングし、さらに観賞植物の超低温保存の分子生物学理論を豊かにする。[方法]iTRAQ技術を用いて、百子蓮胚性カルスの超低温保存の4つの重要なステップ(前培養、ガラス化脱水処理、洗浄と回復培養)における差異発現タンパク質を同定し、バイオインフォマティクス分析法を用いて、細胞応答超低温保存複合逆境のタンパク質調節ネットワークを構築した。植物超低温ストレス保護蛋白質をスクリーニングした。【結果】合計2730の蛋白質を同定し,821個の差次的発現蛋白質をスクリーニングした。GO機能アノテーション分析結果により、差次的発現タンパク質は主に代謝、細胞過程及び刺激応答などの生物学的過程に関与し、一方、触媒活性と分子結合は最も主要な分子機能クラスであることが分かった。KEGG経路分析結果により、差次的発現タンパク質は主にエネルギー代謝、タンパクの合成と分解、シグナル伝達及び細胞質膜修復などの経路に蓄積することが明らかになった。STRINGソフトウェアにより、差次的発現タンパク相互作用制御ネットワークを構築し、アップレギュレーション発現タンパクは主に糖代謝、酸化還元過程とリボソーム翻訳過程に関与し、発現タンパクは主にROS代謝、DNA修復、細胞プログラム細胞死過程と細胞骨格に参与することを発見した。さらに、96個と逆境の保護に関連する差異発現タンパク質をスクリーニングし、それぞれエネルギー代謝、酸化還元平衡、タンパク質合成と分解とシグナル伝達に関与する。[結論]超低温保存過程において、百子蓮の胚性カルスのエネルギー代謝、酸化ストレスとタンパク質分解及びPCDはある程度増加したが、細胞のROS除去とストレス防御過程は明らかに低下した。すなわち、百子蓮胚性カルスは超低温複合逆境下で糖代謝と抗酸化系を主とする抗逆保護メカニズムを形成する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  エネルギー代謝 ,  タンパク質 ,  タンパク質合成 ,  *超低温 ,  酸化還元反応 ,  糖質代謝 ,  *カルス ,  ソフトウェア ,  タンパク質分解 ,  アップレギュレーション ,  酸化ストレス ,  *プロテオミクス ,  バイオインフォマティクス ,  差次的遺伝子発現

分類 (1件)： 植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： 蓮 ,  胚 ,  カルス ,  超低温 ,  過程 ,  プロテオミクス ,  研究