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J-GLOBAL ID：202002212313485704   整理番号：20A1461933

胆道閉鎖関連遺伝子のバイオインフォマティクス分析と機能予測【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis and function prediction of biliary atresia-related genes

著者 (4件)： Zhang Yu (200127,上海交通大学医学院附属仁済医院肝臓外科) ,  Feng Mingxuan (200127,上海交通大学医学院附属仁済医院肝臓外科) ,  Zhu Jianjun (200127,上海交通大学医学院附属仁済医院肝臓外科) ,  Xia Qiang (200127,上海交通大学医学院附属仁済医院肝臓外科)
資料名： Guoji Xiao Hua Bing Zazhi  (Guoji Xiao Hua Bing Zazhi)
巻： 40  号： 2  ページ： 82-86  発行年： 2020年 
JST資料番号： C3950A  ISSN： 1673-534X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:バイオインフォマティクス技術を用い、胆道閉鎖の発生、発展の潜在的な生物学的過程とキー遺伝子を分析する。方法:公共データベースプラットフォーム(GEO)から胆道閉鎖に関連する遺伝子チップデータをダウンロードし、R言語を用い、胆道閉鎖高度に関連する差異遺伝子を分析し、差異遺伝子に対してKEGG分析を行うと、その主要な関与のシグナル経路を詳しく述べる。蛋白質相互作用ネットワークを構築し,主要な情報モジュールを選別した。同時に、GSEAを用いて胆道閉鎖における差異が著しい2つのシグナル経路を選別し、CoreEnrichmentGeneと主要モジュール中の遺伝子を濃縮し、異なる遺伝子による胆道閉鎖診断の正確性を測定した。結果:合計146個の胆道閉鎖と緊密に関連する差異遺伝子を選別し、KEGG分析は、主に細胞外基質-受容体相互作用及び接着などのシグナル伝達経路と関係があることを指摘した。蛋白質相互作用ネットワークを構築した後、21個の差異遺伝子を含むモジュールを選別した。GSEAスクリーニングの結果,胆管閉鎖における差が著しい2つのシグナル経路が細胞外基質-受容体相互作用と接着であることを指摘した。79個のCoreEnrichmentGeneと21個の差異遺伝子を集めて、11個の差異遺伝子を得て、その中のJUNとLAMC2の肝臓組織における発現診断胆道閉鎖の正確性は96.4%であった。結論:バイオインフォマティクス分析により、細胞外基質-受容体相互作用及び接着は胆道閉鎖の発生、発展と密接に関連する可能性があり、11個の重要な差次的遺伝子はこの過程で重要な役割を果たし、JUNとLAMC2は胆道閉鎖の診断にとって重要な意義がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  ネットワーク ,  *遺伝子 ,  受容体 ,  スクリーニング ,  *胆道閉鎖 ,  細胞外マトリックス
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス ,  ジーンチップ ,  蛋白質間相互作用 ,  伝達経路 ,  生物学的過程 ,  KEGG ,  Rパッケージ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 胆道閉鎖 ,  遺伝子 ,  バイオインフォマティクス ,  分析 ,  予測