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J-GLOBAL ID：202002212513254629   整理番号：20A1016538

プリオン病におけるコア転写調節回路【JST・京大機械翻訳】

Core transcriptional regulatory circuits in prion diseases

著者 (12件)： Kim Taek-Kyun (Institute for Systems Biology, Seattle, USA) ,  Lee Inyoul (Institute for Systems Biology, Seattle, USA) ,  Cho Ji-Hoon (Institute for Systems Biology, Seattle, USA) ,  Cho Ji-Hoon (Department of Structural Biology and Developmental Neurobiology, Center for Proteomics and Metabolomics, St. Jude Children’s Research Hospital, Memphis, USA) ,  Canine Brenda (McLaughlin Research Institute, Great Falls, USA) ,  Keller Andrew (Institute for Systems Biology, Seattle, USA) ,  Price Nathan D. (Institute for Systems Biology, Seattle, USA) ,  Hwang Daehee (Center for Plant Aging Research, Institute for Basic Science, Daegu Gyeongbuk Institute of Science and Technology, Daegu, Republic of Korea) ,  Hwang Daehee (Department of Biological Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Carlson George (McLaughlin Research Institute, Great Falls, USA) ,  Carlson George (Institute for Neurodegenerative Diseases, Weill Institute for Neurosciences, University of California, San Francisco, USA) ,  Hood Leroy (Institute for Systems Biology, Seattle, USA)
資料名： Molecular Brain (Web)  (Molecular Brain (Web))
巻： 13  号： 1  ページ： 1-14  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7335A  ISSN： 1756-6606  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 複雑な疾患は,疾患進行中の病態生理学的過程の動的摂動を含む。このような摂動の基礎となる転写プログラムは多くの疾患で知られていない。ここでは,プリオン病における初期および後期摂動の基礎となるコア転写調節回路を提示する。著者らは最初に,3つのプリオン感染マウス株からの時間経過遺伝子発現データを用いて,初期および後期に撹乱された細胞過程を同定した。次に,初期および後期過程の調節を記述する転写調節ネットワーク(TRN)を構築した。TRNにおいて転写因子(TF)対と標的遺伝子を含む過剰発現フィードフォワードループ(FFLs)を見出した。脳細胞型の遺伝子発現データを用いて,TF対と標的遺伝子が同じ細胞型で発現し,脳において相関した時間的発現変化を示す活性FFLsをさらに選択した。最後に,これらの活性なFFLsを組み合わせることにより,コア転写調節回路を決定した。これらの回路はプリオン病における初期および後期病態生理学的過程に対する転写プログラムへの洞察を提供する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： フィードフォワード ,  摂動 ,  遺伝子発現 ,  転写因子 ,  *プリオン性疾患
準シソーラス用語： 疾患進行 ,  *転写調節 ,  標的遺伝子 ,  過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： マウスPrPプリオン病 ,  遺伝子発現 ,  転写調節回路 ,  フィードフォワードループ ,  脳細胞型

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (80件)：

• Science; Systems biology: a brief overview; H Kitano; 295; 5560; 2002; 1662-1664; 10.1126/science.1069492; citation_id=CR1
• Mol Syst Biol; A systems approach to prion disease; D Hwang, IY Lee, H Yoo; 5; 2009; 252; 10.1038/msb.2009.10; citation_id=CR2
• Bioessays; Modeling transcriptional regulatory networks; H Bolouri, EH Davidson; 24; 12; 2002; 1118-1129; 10.1002/bies.10189; citation_id=CR3
• Phys Rev E Stat Phys Plasmas Fluids Relat Interdiscip Topics; Highly optimized tolerance: a mechanism for power laws in designed systems; JM Carlson, J Doyle; 60; 2 Pt A; 1999; 1412-1427; citation_id=CR4
• Proc Natl Acad Sci U S A; Spontaneous evolution of modularity and network motifs; N Kashtan, U Alon; 102; 39; 2005; 13773-13778; 10.1073/pnas.0503610102; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (4件)： プリオン病 ,  コア ,  転写 ,  調節回路