抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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胃におけるABSTRACT臨床介入は糞便微生物叢変化と関連し,胃腸(GI)ホメオスタシスにおける胃の機能を示唆する。ヒト胃(噴門,コーパス,および幽門),隣接上流(食道)および下流(十二指腸)位置,および管腔内容物(吸引),ならびにマウスおよびネズミからの全気孔サンプルにおける異なる部位を含む上部GI管の分類学的細菌生物地理学を決定することを試みた。定性的および定量的DNAおよびRNAベースの分類学的微生物相分析を組み合わせて,ヒトおよびマウスの胃における相対および絶対細菌存在量および転写活性細菌微生物叢成分の関係を研究した。気孔微生物叢組成は食道と十二指腸のそれらと似ていた。しかし,下行GI管に沿って,特定の口咽頭共生体の相対存在量は,減少した(Strptococcus)または増加した(Rothia mucilaginosa,Porphyromonas,およびLachnospiraceae)。さらに,胃吸引物と食道生検サンプルの間の組成類似性(加重UniFrac)は,胃のStreptococcus相対豊度とともに増加した。ヒトの吸引物とマウス胃試料の両方で,FirmicutesはBacteroidetesより転写活性細菌の間でより豊富であった。胃におけるFirmicutesの相対存在量は負の相関があり,Bacteroidetesのそれは絶対細菌豊度と正相関し,より高い細菌密度でのFirmicutesに対するBacteroidetesの不均衡増加を示唆した。ヒト,マウス,およびネズミの胃試料はより高い分類レベルで類似性を示したが,低い分類レベルでは異なっていた。本知見は,胃とFirmicutesにおける特異的細菌分類群の選択的濃縮と枯渇が,総細菌負荷で相対存在量を増加させるBacteroidetesより転写的に活性であることを示唆する。酸阻害またはバイパス手術のようなIMPORTANCE臨床胃介入は,糞便微生物叢変化と関連している。胃微生物叢は,隣接胃腸位置のそれらと大きく重複し,胃内の特異的細菌の相対的存在度を増加させ,選択的濃縮と枯渇を示唆した。さらに,胃と食道試料間の類似性は胃におけるStreptococcus(Firmicutes)の濃度に比例する。胃におけるFirmicutesの相対存在量は,Bacteroidetesと比較して,DNAと比較してRNAにおいて増加し,より高い転写活性を示した。さらに,増加した絶対細菌負荷は,Firmicutesの相対存在量の減少とBacteroidetesのより高い相対豊度と関連する。本知見は,転写的により活性なFirmicutesの背景に対するBacteroidetes流入により影響を受ける胃微生物叢を特徴付ける。ヒト,マウスおよびネズミの胃微生物叢は,より低い分類レベルで異なり,これらモデル生物の有用性に影響する可能性がある。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
