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J-GLOBAL ID：202002213830294771   整理番号：20A0551338

遺伝的多様性を達成するための局所ブタ品種における祖先,部分およびゲノムの比較【JST・京大機械翻訳】

Comparison of ancestral, partial, and genomic inbreeding in a local pig breed to achieve genetic diversity

著者 (4件)： Schaeler J. (Institute of Animal Breeding and Husbandry, Christian-Albrechts-University, Kiel, Germany) ,  Krueger B. (Institute of Zoology, Christian-Albrechts-University, Kiel, Germany) ,  Thaller G. (Institute of Animal Breeding and Husbandry, Christian-Albrechts-University, Kiel, Germany) ,  Hinrichs D. (Faculty of Organic Agricultural Sciences, Department of Animal Breeding, University of Kassel, Witzenhausen, Germany)
資料名： Conservation Genetics Resources  (Conservation Genetics Resources)
巻： 12  号： 1  ページ： 77-86  発行年： 2020年 
JST資料番号： W4194A  ISSN： 1877-7260  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 近交系は,個体群遺伝学において全く存在し避けられない。高レベルの近交系は,遺伝的多様性の減少と近交低下をもたらす。近交の回避は,生産的子孫を創出するために,小集団の管理のための主要な目標であり,育種計画の設計に非常に重要である。本研究の目的は,個々の関連性と異なる近交係数を同定することによって,地方のブタ品種の76の選択候補の子孫における遺伝的多様性を維持する方法を調査した。さらに,祖先,部分,およびゲノム近交の価値ある比較を調べた。データセットは,1980年から2015年の間に生まれた1273人の個人の家系と2004年から2014年の間に生まれた選択候補の遺伝子型を含んだ。古典的,祖先的,および部分的近交係数を,家系情報に基づいて計算した。ゲノム係数を4つのアプローチを用いて計算した:(i)付加的遺伝的価値の分散,(II)SNPホモ接合性,(III)結合配偶子,および(IV)ホモ接合性の実行。選抜候補の近交レベルは高くなく,数匹の動物は近交係数の増加を示した。この結果は,個体間の推定関連性と一致した。最も低いおよび最も高い系統発生は,部分的(0.004-0.006)および祖先の概念(0.024-0.090)の範囲内で推定された。ゲノム近交は低く,異なるゲノム係数(0.000-0.012)間で明らかな差を示した。家系とゲノム近交係数の間の相関は-0.44から0.57の範囲であった。祖先近交系のBalouの概念は,ホモ接合性(0.39),配偶子(0.24)およびホモ接合性(0.49)のランのゲノム推定量と適度に相関していた。祖先近交系のKalinowskiの概念は,付加的遺伝的価値(-0.44)と配偶子(-0.29)の分散に関するゲノムの近交測定と負の相関があった。部分近交の相関は0.22と0.48の間で変化し,そこでは,「新しい」近交のKalinowskiの概念はすべてのゲノム近交係数(0.25-0.48)と正の相関があった。しかしながら,部分的な近交系のLayの概念は,ホモ接合性(0.26)とホモ接合性(0.22)の実行に関して,ゲノムの近交と正に相関していた。祖先および部分近交は,特に小集団に対して遺伝的多様性を得るために個々の交配を通して有害な対立遺伝子の浄化に関して非常に重要である。ROHに基づく近交推定子は,付加的遺伝的価値,SNPホモ接合性,または配偶子のゲノム係数よりも,祖先および部分的な近交概念をより良く表す可能性がある。Copyright Springer Nature B.V. 2018 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 対立遺伝子 ,  同系交配 ,  推定量 ,  *ゲノム ,  集団遺伝 ,  系統発生 ,  配偶子 ,  家系 ,  動物 ,  遺伝子型 ,  *遺伝 ,  *品種
準シソーラス用語： 近交係数 ,  近交系 ,  *遺伝多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 遺伝的多様性 ,  ゲノムの近交 ,  地方の品種 ,  ROH

分類 (3件)： 牛  (FD02020Y) ,  集団遺伝学  (EC01040J) ,  飼育動物の育種  (FD01020R)

タイトルに関連する用語 (4件)： 遺伝的多様性 ,  ブタ ,  品種 ,  ゲノム