文献

J-GLOBAL ID：202002214376640210   整理番号：20A0866873

遺伝子オントロジーによる蛋白質の四次構造型の新規予測【JST・京大機械翻訳】

A Novel Prediction of Quaternary Structural Type of Proteins with Gene Ontology

著者 (3件)： Xiao Xuan (School of Information, Jingdezhen Ceramic Institute, Jingdezhen 333403, China) ,  Chen Wei-Jie (School of Information, Jingdezhen Ceramic Institute, Jingdezhen 333403, China) ,  Qiu Wang-Ren (School of Information, Jingdezhen Ceramic Institute, Jingdezhen 333403, China)
資料名： Protein and Peptide Letters  (Protein and Peptide Letters)
巻： 27  号： 4  ページ： 313-320  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3645A  ISSN： 0929-8665  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 不明 (ARE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:蛋白質の四次構造属性の情報は,それが蛋白質の生物学的機能に密接に関連するので,非常に重要である。新しい世代配列決定技術の急速な発展により,それらの配列情報に従って新しいポリペプチド鎖の4レベル属性を自動的に同定する方法(すなわち,それらが単量体として形成されるか,ヘテロオリゴマまたはホモオリゴマとして)を自動的に同定するかに直面している。目的:この論文では,蛋白質配列を表す新しい方法を見出し,それにより蛋白質四次構造の予測速度を改善した。方法:本論文では,蛋白質配列がPfam機能ドメインと遺伝子オントロジーを組み合わせて発現される蛋白質四次構造型の予測システムを開発し,特異的機械学習アルゴリズムと検証アルゴリズムを通して四次構造の予測を完了した。【結果】著者らのデータセットは,5495の蛋白質サンプルを含んだ。本論文で提供された方法を通して,蛋白質を単量体に分類し,ヘテロオリゴマまたはホモオリゴマとして,予測率は74.38%であり,以前の研究のものより3.24%高い。この新しい特徴抽出法を通して,蛋白質の4レベル構造をさらに分類することができ,結果も対応して改善される。結論:新しい予測システムを適用した後,以前の結果と比較して,予測率を改善することに成功した。著者らは,本論文における特徴抽出方法がより良い実行可能性を持って,他の蛋白質分類問題のための参考として使用することができると信じていた。Copyright 2020 Bentham Science Publishers All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  特徴抽出 ,  ポリペプチド ,  アミノ酸配列 ,  *タンパク質 ,  単量体 ,  *四次構造 ,  オリゴマ ,  生物活性 ,  学習アルゴリズム
準シソーラス用語： 蛋白質四次構造 ,  ドメイン構造 ,  予測システム ,  ランダムフォレスト ,  *遺伝子オントロジー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 蛋白質四次構造 ,  PFAM ,  機能ドメイン構成 ,  遺伝子オントロジー ,  ランダムフォレストアルゴリズム ,  ジャックナイフ試験

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (4件)： 遺伝子オントロジー ,  蛋白質 ,  四次構造 ,  予測