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J-GLOBAL ID：202002214801918954   整理番号：20A0481647

ASAMの乾燥耐性イネ遺伝子型からの乾燥応答miRNAの同定と特性化【JST・京大機械翻訳】

Identification and characterization of drought responsive miRNAs from a drought tolerant rice genotype of Assam

著者 (6件)： Singh Sanjay (Department of Agricultural Biotechnology, Assam Agricultural University, Jorhat 785013, India) ,  Kumar Amrendra (Distributed Information Centre, Department of Agricultural Biotechnology, Assam Agricultural University, Jorhat 785013, India) ,  Panda Debashis (Distributed Information Centre, Department of Agricultural Biotechnology, Assam Agricultural University, Jorhat 785013, India) ,  Modi Mahendra Kumar (Department of Agricultural Biotechnology, Assam Agricultural University, Jorhat 785013, India) ,  Modi Mahendra Kumar (Distributed Information Centre, Department of Agricultural Biotechnology, Assam Agricultural University, Jorhat 785013, India) ,  Sen Priyabrata (Department of Agricultural Biotechnology, Assam Agricultural University, Jorhat 785013, India)
資料名： Plant Gene  (Plant Gene)
巻： 21  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3471A  ISSN： 2352-4073  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： イネ生産は,特に穂の開始と開花段階の間に遭遇すると,干ばつによって不利に制約される。いくつかの伝統的なイネ栽培品種/在来種は,多様な環境的有害性における適応の固有の機能的機構を持っている。オミクスレベルにおけるこれらの伝統的な耐性生殖質の遺伝的および分子的特性化は,ストレス耐性を調節するスキーマおよび分子ネットワークを理解するために重要であり,最終的にストレス耐性に関与する候補遺伝子を同定するために重要である。本研究は,Assam Rice Collectionの干ばつ耐性の重要なイネ遺伝子型であるARC-10372における干ばつストレスに対する応答におけるmiRNAの解明を試みた。小RNA配列決定を行い,乾燥ストレスおよび対照試料の両方において,合計45,742,638の良好な品質を得た。アノテーションにおいて,178および131の既知miRNAが,それぞれ対照および乾燥試料において発現されることが分かった。これらのうち,58のファミリーに属する109の既知miRNAが差別的に発現していることが分かった。9つの(9)以前に報告された干ばつ応答性miRNAはARC-10372において有意に発現し,それらの発現パターンは以前の研究と類似しており,干ばつ応答として以前に報告されていなかった10miRNA(miR531,miR827,miR8175miR977,miR6300,miR1861,miR440,miR9773,miR3982およびmiR1876)はこの地方在来種における干ばつストレス下で有意に調節されることが分かった。in silico同定は,これらのmiRNAの大部分の標的がNAC,MYB,MYC,ARFのような転写因子であることを明らかにし,それによりストレス適応時の調節におけるそれらの役割をさらに確認した。4つの新しいストレス応答miRNAはストレス関連転写物を標的とした。sRNA配列決定データにおけるmiRNAの発現パターンをqPCRにより検証し,それらのほとんどはNGSデータと一致した。報告された研究に照らして,本研究は,干ばつ耐性イネ品種ARC-10372における穂の開始段階における葉の乾燥調節されたmiRNomeの比較側面を初めて与える。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： キャラクタリゼーション ,  有害性 ,  応答特性 ,  品質 ,  栽培品種 ,  定量的PCR法 ,  干ばつ ,  アノテーション ,  品種 ,  *遺伝 ,  耐干性 ,  在来種 ,  開花 ,  転写因子 ,  *遺伝子型

著者キーワード (5件)： miRNA ,  イネ ,  SRNAシークエンシング ,  ARC-10372 ,  QPCR

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： 乾燥耐性 ,  イネ ,  遺伝子型 ,  応答 ,  miRNA ,  同定 ,  特性化