包括的同位体標的質量分析:広い被覆率を有する信頼できる代謝フラックス解析【JST・京大機械翻訳】

Shi Xiaojian; Xi Bowei; Jasbi Paniz; Turner Cassidy; Jin Yan; Gu Haiwei

文献

J-GLOBAL ID：202002214951003364 整理番号：20A2331816

包括的同位体標的質量分析:広い被覆率を有する信頼できる代謝フラックス解析【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Isotopic Targeted Mass Spectrometry: Reliable Metabolic Flux Analysis with Broad Coverage

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著者 (6件)： , , , , ,
資料名：
巻： 92 号： 17 ページ： 11728-11738 発行年： 2020年
JST資料番号： A0395A ISSN： 0003-2700 CODEN： ANCHAM 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

代謝フラックス分析(MFA)は,様々な生物学的過程の代謝メカニズムの理解に高度に関連している。MFAにおける方法論開発のペースは迅速であるが,その分野は,特によく知られた化合物の数から中程度の数に限定された代謝産物被覆を制約するという大きな挑戦である。さらに,濃縮代謝産物からの同位体ピークは低存在量であり,液体クロマトグラフィータンデム質量分析(LC-MS/MS)はその高感度及び特異性によりMFAにおいて高度に有用である。以前に,約1,900の代謝物/特徴レベル[[引用文献情報:原文を参照].[引用文献情報:原文を参照]]の測定に日常的に使用できる大規模LC-MS/MSアプローチを構築した。本研究では,フラックス分析に対する代謝物レベル測定に焦点を当てた以前の研究を拡大し,広い被覆率を有する信頼できるMFA分析のための新規包括的同位体標的質量分析(CIT-MS)法を確立した。原理証明として,U-13C_6-グルコース培地で培養したMyc-(癌遺伝子)-OnとMyc-Off Tet21Nヒト神経芽細胞腫細胞の間の代謝物の定常状態濃縮を比較するためにCIT-MSを適用した。CIT-MSは多重反応モニタリング(MRM)モードを用いて操作され,310の同定された代謝産物のMFA(確実に検出された142,46の動力学的プロファイル)を,強い生物学的意義の>35の代謝経路から選択した。さらに,著者らは,従来のMFAにおける絶対定量の必要条件を除去する相対的フラックスの新規概念を開発し,その結果,擬似定常状態の下で比較MFAを可能にした。その結果,CIT-MSは,広いカバレッジ,容易な実装,高速スループット,およびより重要なことに,MFAにおける高い忠実度と精度の利点を有することが示された。原理的に,CIT-MSは,LC-MS/MSによって検出可能な任意の代謝物中の他の標識トレーサー(15N-トレーサ)のフラックスを追跡するために容易に適応でき,種々の生物学的モデル(例えばマウスなど)で検出できる。したがって,CIT-MSは,基礎および臨床代謝研究の両方への新たな洞察をもたらす大きな可能性を有する。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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代謝一般 , 有機化合物の各種分析 , 生物物理的研究法

引用文献 (2件)：

Gu et al. Anal. Chem. 2015, 87, 12355-12362
Shi et al. Anal. Chem. 2019, 91, 13737-13745

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