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J-GLOBAL ID：202002215161332520   整理番号：20A1202705

アデノシンG蛋白質共役受容体におけるアロステリック調節因子の遡及的アンサンブルドッキング【JST・京大機械翻訳】

Retrospective ensemble docking of allosteric modulators in an adenosine G-protein-coupled receptor

著者 (3件)： Bhattarai Apurba (Center for Computational Biology and Department of Molecular Biosciences, University of Kansas, Lawrence, KS 66047, USA) ,  Wang Jinan (Center for Computational Biology and Department of Molecular Biosciences, University of Kansas, Lawrence, KS 66047, USA) ,  Miao Yinglong (Center for Computational Biology and Department of Molecular Biosciences, University of Kansas, Lawrence, KS 66047, USA)
資料名： Biochimica et Biophysica Acta  (Biochimica et Biophysica Acta)
巻： 1864  号： 8  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0207A  ISSN： 0005-2728  CODEN： BBBMBS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アンサンブルドッキングは創薬と開発に有用であることが証明されている。それは,G蛋白質共役受容体(GPCR)を含む重要な薬物標的で示されるように,受容体の柔軟性を分子ドッキングに組み込むことにより,ヒット率を増加させる。アデノシンA_1受容体(A_1AR)は,心臓虚血-再潅流障害,神経障害性疼痛および腎疾患を治療するために標的化された重要なGPCRである。アロステリック調節因子の開発,アゴニストおよびアンタゴニストと比較して,異なるおよびより少ない保存されたGPCR標的部位への化合物の結合は,A_1ARの選択的薬物の設計に対する興味の増加を引き付けている。有意な進歩にもかかわらず,A_1ARの強力で選択的なアロステリック調節因子を発見するために,より効果的なアプローチが必要である。Gaussian加速分子動力学(GaMD)シミュレーションとAutodockを用いた分子ドッキングを統合する集合ドッキングを,A_1ARにおける既知の正のアロステリック調節因子(PAM)の遡及的ドッキングのために実行した。アンサンブルドッキングは受容体低温EM構造のドッキングより優れている。計算したドッキング濃縮係数(EFs)と受信者動作特性曲線(AUC)の下の面積は,著しく増加した。GaMDシミュレーションから発生した受容体集合は,A_1ARのPAMs発見の成功率を増加させることができる。GaMDシミュレーションと柔軟なドッキングを通して受容体の柔軟性を説明することは重要である。アンサンブルドッキングは,柔軟な受容体を標的とする薬物発見のための有望なアプローチである。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： シミュレーション ,  低温 ,  *ドッキング ,  心臓 ,  *アロステリック効果 ,  *受容体 ,  腎臓病 ,  分子動力学 ,  ターゲティング ,  診断用薬 ,  プリンヌクレオシド ,  リボヌクレオシド
準シソーラス用語： *G蛋白質共役型受容体 ,  アゴニスト ,  創薬 ,  アンタゴニスト ,  *アロステリック調節因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アデノシンA1受容体 ,  アロステリック調節剤 ,  Gauss加速分子動力学 ,  アンサンブルドッキング ,  G蛋白質共役受容体

分類 (1件)： 細胞膜の受容体  (EF04030C)

物質索引 (1件)： アデノシン

タイトルに関連する用語 (5件)： アデノシン ,  G蛋白質共役受容体 ,  アロステリック調節因子 ,  アンサンブル ,  ドッキング