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J-GLOBAL ID：202002216137387990   整理番号：20A0956112

分子形状と構造に基づく仮想スクリーニング法による新規細菌ウレアーゼ阻害剤の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of novel bacterial urease inhibitors through molecular shape and structure based virtual screening approaches

著者 (10件)： Imran Muhammad (School of Life Sciences, FC College University, Lahore, Pakistan) ,  Waqar Saba ,  Ogata Koji ,  Ahmed Mahmood ,  Noreen Zobia ,  Javed Sundus ,  Bibi Nazia ,  Bokhari Habib ,  Amjad Asma ,  Muddassar Muhammad
資料名： RSC Advances (Web)  (RSC Advances (Web))
巻： 10  号： 27  ページ： 16061-16070  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7055A  ISSN： 2046-2069  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 酵素ウレアーゼは,細菌に対する酸耐性を付与する,notori性発癌性病原体Helicobacter pylori(H.pylori)の必須コロニー形成因子である。最近,抗生物質耐性株は,利用可能な代替処理がほとんどなく世界的に出現している。本研究では,H.pyloriおよび他の病原性細菌による感染を制御できる新規ウレアーゼ阻害剤を提案する。著者らは,市販の化学データベースから新しいウレアーゼ阻害剤をスクリーニングするために階層的な計算アプローチを採用し,続いてin vitroでの抗ウレアーゼ試験を行った。最初に,ROCS形状に基づくスクリーニングを,o-クロロ-hipプロヒドロキサム酸を用いて行い,続いて分子ドッキング研究を行った。1.38百万の化合物のうち,1700の化合物は,1.2~1.679の範囲の値の範囲で,ROCS Tanimotocombスコアを有することに基づいて検索された。これらの化合物をさらに分子ドッキングシミュレーションを用いてスクリーニングし,100のトップランク化合物をそれらのGideスコアに基づいて選択した。トップランク化合物の構造分類の後,8つの化合物を選択し,生物学的アッセイのために購入した。最も活性な化合物の妥当な結合モードも分子動力学(MD)シミュレーションを用いて確認した。化合物1,2及び3は他の化合物と比較して良好なウレアーゼ阻害特性(IC50=0.32,0.68及び0.42μM)を示した。酵素速度論研究は,化合物1と3が競合阻害剤であるが,2はウレアーゼ酵素の混合型阻害剤であることを明らかにした。細胞に基づくウレアーゼ阻害とMTTアッセイは,これらの化合物がH.pyloriウレアーゼ活性を阻害し,細菌増殖と酸耐性に影響を及ぼすことを示した。Copyright 2020 Royal Society of Chemistry All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *分子構造 ,  計算機シミュレーション ,  *細菌 ,  酵素 ,  *ウレアーゼ ,  バイオアッセイ ,  酵素反応速度論 ,  耐酸性 ,  病原体 ,  分子動力学 ,  in vitro実験 ,  コロニー形成 ,  *バーチャルスクリーニング ,  細菌増殖 ,  分子ドッキングシミュレーション ,  ヘリコバクター属 ,  計算機利用 ,  利用 ,  *微生物 ,  らせん菌
準シソーラス用語： Helicobacter , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (7件)： 分子形状 ,  仮想 ,  スクリーニング法 ,  細菌 ,  ウレアーゼ ,  阻害剤 ,  同定