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J-GLOBAL ID：202002217125016214   整理番号：20A1033383

Vigna nakashimae var.UkishiとG418の全ゲノム配列データ【JST・京大機械翻訳】

Whole genome sequencing data of Vigna nakashimae var. Ukushima and G418

著者 (8件)： Ogiso-Tanaka Eri (Genetic Resources Center, National Institute of Agrobiological Sciences (NIAS), 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan) ,  Chankaew Sompong (Program in Plant Breeding, Faculty of Agriculture at Kamphaeng Saen, Kasetsart University, Kamphaeng Saen, Nakhon Pathom 73140, Thailand) ,  Isemura Takehisa (Genetic Resources Center, National Institute of Agrobiological Sciences (NIAS), 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan) ,  Kongjaimun Alisa (Research Fellow of the Japan Society for the Promotion of Science, Japan) ,  Baba Akiko (Genetic Resources Center, National Institute of Agrobiological Sciences (NIAS), 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan) ,  Naito Ken (Genetic Resources Center, National Institute of Agrobiological Sciences (NIAS), 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan) ,  Kaga Akito (Genetic Resources Center, National Institute of Agrobiological Sciences (NIAS), 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan) ,  Tomooka Norihiko (Genetic Resources Center, National Institute of Agrobiological Sciences (NIAS), 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan)
資料名： Data in Brief  (Data in Brief)
巻： 29  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3049A  ISSN： 2352-3409  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Vigna nakashimaeは,Vigna angularis(アズキ)の近縁種の1つである。遺伝子バンク収集からVigna nakashimaeにおける塩耐性株として「Ukushima」と「G418」の2株を同定した。高感度株と耐性株の間の相互または内部特異的交雑からのF_2集団は,Vigna nakashimaeにおける塩耐性QTLの検出に有用である。Vigna angularis参照ゲノムは利用可能であり,密接に関連する種における遺伝子タイピング/RADseqによる遺伝子解析に有用であるが,責任遺伝子の単離には十分ではない。Vigna nakashimae「Ukushima」と「G418」の配列変化を明らかにするために,Illina HiSeqX Tenシステム(411,174,986と478,116282読取)を用いて全ゲノム配列決定を行った。NGSデータは,受入番号DRA009307の下で日本のDNAデータバンク(DDBJ)において堆積された。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  DNA【核酸】 ,  *ゲノム ,  交雑 ,  アズキ ,  耐塩性 ,  高感度 ,  単離 ,  *ササゲ属
準シソーラス用語： 遺伝子解析 ,  *ゲノム配列 ,  近縁種 ,  遺伝子タイピング ,  ジーンバンク ,  耐性株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Vigna Nakashimae ,  アズキの近縁種 ,  次世代シークエンシング ,  HISEQ ,  全ゲノム配列決定

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  豆類  (FC03035U)

タイトルに関連する用語 (2件)： Vigna ,  ゲノム配列