ACE2変異体N720Dの構造解析はTMPRSS2に対する高い結合親和性を示す【JST・京大機械翻訳】

Mohammad Anwar; Marafie Sulaiman K.; Alshawaf Eman; Abu-Farha Mohamed; Abubaker Jehad; Al-Mulla Fahd

文献

J-GLOBAL ID：202002217128115076 整理番号：20A2245736

ACE2変異体N720Dの構造解析はTMPRSS2に対する高い結合親和性を示す【JST・京大機械翻訳】

Structural analysis of ACE2 variant N720D demonstrates a higher binding affinity to TMPRSS2

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資料名：
巻： 259 ページ： Null 発行年： 2020年
JST資料番号： B0699B ISSN： 0024-3205 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)は,主にそのS蛋白質を介してアンギオテンシン変換酵素2(ACE2)への結合を介して下気道に影響するベタコナウイルスファミリーの新規メンバーである。(ACE2)遺伝子の遺伝子分析は,S蛋白質との相互作用を調節することが示唆されているいくつかの変異体を明らかにした。本研究では,II型膜貫通セリンプロテアーゼ(TMPRSS2)切断部位近傍において,コレトリン様ドメイン(CLD)に位置するN720D変異体を調べた。ACE2構造と熱力学的安定性に及ぼすN720D変異体の影響をDynaMutによって研究した。HDOCKを用いて,ACE2 WTおよびD720変異体切断部位へのTMPRSS2プロテアーゼ結合をモデル化した。PRODIGYを用いて,ACE2アポ構造とACE2-TMPRSS2複合体について100nsで計算した結合親和性とMDシミュレーションツールを計算した。N720D変異体は,自由エネルギー変化(ΔΔG):-0.470kcal/molを有するより動的な構造である。このように,TMPRSS2とN720D変異体の間にK_d=3.2×10-10Mのより緊密な結合親和性を導入する。RMSD,RMSF計算は,N720D変異体が不安定であることを示したが,D720-TMPRSS2複合体のRMSF値はより遅い動的運動を反映した。ACE2のCLDにおけるホットスポットN720D変異体は,ループ領域における運動レベルを増加させることによりACE2の安定性および柔軟性に影響し,TMPRSS2結合および切断のためのより好ましい部位をもたらした。従って,これはS-蛋白質結合を促進し,ACE2-TMPRSS2複合体に影響する変異体の重要性を強調するウイルス侵入を潜在的に増加させる。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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細胞膜の受容体 , 生物学的機能 , 循環系の基礎医学 , 遺伝子発現

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