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J-GLOBAL ID：202002217357521864   整理番号：20A2343645

トランスクリプトーム解析はトウガラシの低温ストレスに関与する候補遺伝子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome Analysis Reveals Candidate Genes Involved in Low Temperature Stress in Bell Pepper

著者 (5件)： Ji L. (College of Pharmacy, Liaocheng University, Liaocheng City, Shandong Province, China) ,  Li P. (College of Pharmacy, Liaocheng University, Liaocheng City, Shandong Province, China) ,  Su Zh. (College of Life Science, Liaocheng University, Liaocheng City, Shandong Province, China) ,  Li M. (College of Life Science, Liaocheng University, Liaocheng City, Shandong Province, China) ,  Wang H. (College of Horticulture, Zhejiang A&F University, Hangzhou City, Zhejiang Province, China)
資料名： Russian Journal of Plant Physiology  (Russian Journal of Plant Physiology)
巻： 67  号： 6  ページ： 1116-1125  発行年： 2020年 
JST資料番号： A1029A  ISSN： 1021-4437  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 寒冷ストレスはピーマン(Capsicum annuum L.)の成長および発達に影響する重要な環境条件であるが,基礎となる分子機構は不明である。本研究はピーマンにおける低温ストレス応答に関連する遺伝子を探索することを目的とした。本研究では,Bell コショウ Zhongjiao NO.4’(CRC,耐寒性品種)および「Zhong 30’(WT,寒冷感受性品種)を用いた。CRCを4°C,0時間(Low),8時間(Low8),16時間(Low16),および24時間(Low24)で増殖させ,WTを4°Cで増殖させた。ピーマンのトランスクリプトームプロファイルを,Illumina RNA配列決定により得た。低とWT群の間の差次的発現遺伝子(DEG)を探索し,低8,低16,および低24の2群間のDEGもスクリーニングした。低グループ間のDEGの時系列クラスタリング分析を行った。DEGの機能的濃縮分析をクラスタプロファイラパッケージを用いて行い,蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)分析を行った。結果は,CRCにおけるDEGがフラボノイド生合成とフェニルアラニン代謝に関与することを示した。時間経過関連DEGの機能的濃縮分析は,遺伝子が代謝過程,光合成および脂質代謝過程に主に関連することを示した。LOC107864131,LOC107857080,およびLOC107855212はハブ遺伝子と考えられ,ピーマンの寒冷ストレスにおいて重要な役割を担っていた。一方,リボソーム蛋白質関連遺伝子の発現レベルは,寒冷処理の間に有意に下方制御された。動的発現変化は,ピーマンの寒冷ストレス応答における遺伝子の調節的役割を明らかにした。著者らの知見は,ピーマンにおける耐寒性に関連する分子機構に光を当て,遺伝的改良のための有用な候補遺伝子を提供するかもしれない。Copyright Pleiades Publishing, Ltd. 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： コショウ ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  光合成 ,  脂質代謝 ,  ピーマン ,  クラスタ ,  品種 ,  フラボノイド ,  *寒冷ストレス ,  ダウンレギュレーション ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 分子機構 ,  *候補遺伝子 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Capsicum annuum ,  ピーマン ,  低温ストレス応答 ,  トランスクリプトーム ,  差次的発現遺伝子 ,  時系列クラスタリング解析 ,  機能的濃縮分析

分類 (2件)： 植物生理学一般  (EH02010Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： トランスクリプトーム解析 ,  トウガラシ ,  低温ストレス ,  候補遺伝子