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J-GLOBAL ID：202002217772822735   整理番号：20A2567641

小角X線散乱と変分Bayes重みづけの組み合わせによるプレフィブリルWT α-シヌクレインとそのG51D,E46K,およびA53T変異体の包括的構造的および熱力学的解析【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Structural and Thermodynamic Analysis of Prefibrillar WT α-Synuclein and Its G51D, E46K, and A53T Mutants by a Combination of Small-Angle X-ray Scattering and Variational Bayesian Weighting

著者 (7件)： Moretti Paolo (Department of Life and Environmental Sciences, Polytechnic University of Marche, Marche, Italy) ,  Mariani Paolo (Department of Life and Environmental Sciences, Polytechnic University of Marche, Marche, Italy) ,  Ortore Maria Grazia (Department of Life and Environmental Sciences, Polytechnic University of Marche, Marche, Italy) ,  Plotegher Nicoletta (Department of Biology, University of Padova, Veneto, Italy) ,  Bubacco Luigi (Department of Biology, University of Padova, Veneto, Italy) ,  Beltramini Mariano (Department of Biology, University of Padova, Veneto, Italy) ,  Spinozzi Francesco (Department of Life and Environmental Sciences, Polytechnic University of Marche, Marche, Italy)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 60  号： 10  ページ： 5265-5281  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 溶液シンクロトロン小角X線散乱SAXS法を用いて,プレフィブリル希釈条件でのParkinson病,α-シヌクレイン(α-syn)に関連する本質的に無秩序な蛋白質(IDP)を調べた。SAXS実験を,野生型(WT)および3つの病原性変異体G51D,E46KおよびA53Tに対する温度および濃度の関数として行った。WT α-synと前フィブリル条件における病原性変異体をポピュレートする配座異性体を同定するために,螺旋リッチおよび鎖リッチ型の両方において,非折畳み単量体,三量体および四量体を含む,配座異性体の集合に基づく新しい変分ベイジアン重み付け法(VBWSAS)により,散乱データを解析した。開発したVBWSAS法は,温度と濃度効果を説明するために熱力学スキームを用い,ランダム位相近似の枠組みにおける長距離蛋白質-蛋白質相互作用を考慮する。全体のデータセットの全体的な分析は,WT α-synが,いくつかの研究で以前に誘導されたように,四量体ではなく,非折畳み単量体と三量体(高Tでのヘリックスリッチ三量体)として大部分が存在することを示した。それどころか,異なる配座異性体組合せは変異体を特徴付ける。α-syn G51D変異体において,すべての温度で最も豊富な凝集体は鎖に富む四量体である。また,Strandリッチ四量体はA53T変異体において優勢な形態であるが,それらの重量は温度とともに減少する。E46K変異体には,最も小さいサイズの優先性を持つ単量体配座異性体のみが存在する。誘導した立体配座挙動は,変異,温度,および濃度に依存し,α-syn変異体の異なる神経毒性を説明する,凝集する傾向がある種の異なる利用性を示唆する。実際,この方法は他のIDPの立体配座および凝集特性を記述するのに極めて重要である。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 凝集 ,  *散乱 ,  *熱力学 ,  *変分法 ,  立体配座 ,  希釈 ,  タンパク質 ,  デコンボリューション ,  単量体 ,  三量体 ,  四量体 ,  野生型 ,  凝集体
準シソーラス用語： 配座異性体 ,  *α-シヌクレイン , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

タイトルに関連する用語 (7件)： 小角X線散乱 ,  変分 ,  重みづけ ,  組み合わせ ,  α-シヌクレイン ,  変異体 ,  力学的解析