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J-GLOBAL ID:202002218226088731   整理番号:20A0792771

ヒマワリ(Helianthus annuus L.)におけるWRKY遺伝子の系統学的解析と転写プロファイリング:遺伝的多様性と異なる生物的および非生物的ストレスに対するそれらの応答【JST・京大機械翻訳】

Phylogenetic analysis and transcriptional profiling of WRKY genes in sunflower (Helianthus annuus L.): Genetic diversity and their responses to different biotic and abiotic stresses
著者 (8件):
資料名:
巻: 148  ページ: Null  発行年: 2020年 
JST資料番号: W0732A  ISSN: 0926-6690  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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WRKY蛋白質は,生理学的プロセスの多くの側面と環境問題への適応において重要な役割を果たす転写因子の大きなファミリーを構成する。以前の研究では,ヒマワリ(Helianthus annuus L.)発現配列タグおよびゲノムデータベースからWRKY遺伝子を同定し,特性化したが,油作物種のWRKYレパートリーの系統発生的多様性および種々のストレス因子に対するヒマワリWRKY蛋白質の応答は解明されていない。本研究では,7つの油作物種,すなわちヒマワリ,ゴマ,ゴマ,ダイズ,カノーラ,Arachis duranensis,およびArachis ipaensisからの合計860のWRKYメンバーを比較ゲノム分析にかけた。これらの油作物種間のWRKYファミリー内の遺伝的多様性を,オーソロググループと系統発生分析の対比較により明らかにした。配列特徴と系統発生分析により,油作物種のWRKY遺伝子は明確なグループまたはサブグループに属し,異なる油植物種は異なる程度に明らかな拡大または損失を示すことを明らかにした。119のヒマワリWRKY(HaWRKY)遺伝子は各染色体にわたって不均一に分布していることが分かった。セグメントおよびタンデム重複は,それぞれヒマワリにおけるグループIIおよびIII WRKY遺伝子の拡大に寄与した。重複した遺伝子は一般的に発散的な発現パターンを示し,これらの遺伝子の新機能化またはサブ機能化が重複後に起こる傾向があることを示している可能性がある。さらに,トランスクリプトームデータから誘導された発現プロファイルは,種々の組織におけるHaWRKY遺伝子の異なる発現パターンを示し,ホルモン処理,塩および乾燥ストレス,菌類Verticillium dahliaeによる感染,および菌類Rhizoglomus不規則性によるコロニー形成を含む異なるストレス処理に応答した。これらの結果によると,WRKY遺伝子は様々な環境に対するヒマワリの強い適応性に関与している可能性があり,広く栽培されている油資源としてのヒマワリの重要性に寄与している可能性がある。この系統的な分析は,ストレス耐性の改善のための油作物種間のWRKY遺伝子の更なる機能的特性化の基礎を提供する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (3件):
分類
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油料作物  ,  植物の生化学  ,  生物燃料及び廃棄物燃料 
タイトルに関連する用語 (11件):
タイトルに関連する用語
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