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J-GLOBAL ID：202002218835181781   整理番号：20A0200725

単一ヌクレオチド多型(SNPs)は,Mastiffコウモリ(Molossus)における種境界,系統発生関係および遺伝的多様性の前例のない分解能を提供する【JST・京大機械翻訳】

Single nucleotide polymorphisms (SNPs) provide unprecedented resolution of species boundaries, phylogenetic relationships, and genetic diversity in the mastiff bats (Molossus)

著者 (5件)： Loureiro Livia O. (Department of Natural History, Royal Ontario Museum, Toronto, ON M5S 2C6, Canada) ,  Loureiro Livia O. (Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Toronto, Toronto, ON M5S 3B2, Canada) ,  Engstrom Mark D. (Department of Natural History, Royal Ontario Museum, Toronto, ON M5S 2C6, Canada) ,  Engstrom Mark D. (Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Toronto, Toronto, ON M5S 3B2, Canada) ,  Lim Burton K. (Department of Natural History, Royal Ontario Museum, Toronto, ON M5S 2C6, Canada)
資料名： Molecular Phylogenetics and Evolution  (Molecular Phylogenetics and Evolution)
巻： 143  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1678A  ISSN： 1055-7903  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 哺乳類は動物のより良く知られたグループの1つであり,新熱帯コウモリでは典型的に哺乳類の種の多様性の約半分を占めている。しかし,良く分解された種レベルの系統発生はコウモリのほとんどの分類群に対してまだ欠けている。1つの広く分布する属は,マスチフコウモリ,Molossusである。この属内の種は形態学的に非常に類似しており,混乱と不安定な分類をもたらす。加えて,いくつかのクレード間の低レベルの遺伝的相違は,系統発生的関係の解決を困難にする。ほとんどの著者らはMolossusを単系統性であると認識しているが,属内の系統発生的関係は個々の遺伝子の伝統的なSanger配列決定に基づいてほとんど理解されていない。豊富な分類学的歴史を持つ密接に関連する種のグループ内の進化的関係をより良く理解するために,Next世代配列技術に由来する大規模ゲノムデータに基づくより包括的な枠組みを提案した。本研究では,遺伝子型のNGS法を配列決定(GBS)により利用し,属の単系統性を試験し,Molossus内の進化的関係を理解し,現在認識されている種の遺伝的完全性を調べた。GBSからの単一ヌクレオチド多型データの集合において,de novoと参照ゲノムパイプラインの両方がしばしば使用されると考えられ,いくつかのツリー推論方法がSNPデータに対して提案され,異なるアラインメントと系統発生アプローチが類似の結果を生み出すかどうかを試験した。また,SNP同定とマッピングのプロセスが分析の一貫性にどのように影響するかを調べた。著者らのデータは,属Molossusのための最初の高分解能系統発生を提供し,種境界の認識と分類群間の関係に新しい洞察をもたらす。本研究は,Molossusの分類を明らかにし,11から14までの属における種の数を上げる。著者らは名前M.nigricansとM.fluminensisの再検証を提案し,M.rufusと命名した。そして,M.bondaeは,以前に命名された。異なる配列と系統発生学的推論は一貫した結果を生み出し,クレード間の遺伝的距離が低いマクロ進化規模に関する進化的疑問に対処するSNPアプローチの利用を支持する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  哺乳類 ,  遺伝子 ,  分解能 ,  高分解能 ,  *コウモリ ,  *系統発生 ,  *一塩基多型 ,  モルフォロジー ,  熱帯 ,  完全性 ,  動物 ,  *遺伝 ,  アラインメント
準シソーラス用語： クレード , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 次世代シークエンシング ,  シークエンシングによる遺伝子型 ,  Molossidae ,  系統発生 ,  分類学

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  動物分類学  (EJ01030T)

タイトルに関連する用語 (8件)： 単一ヌクレオチド多型 ,  SNPs ,  コウモリ ,  種 ,  境界 ,  系統発生 ,  遺伝的多様性 ,  分解能