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J-GLOBAL ID：202002219337191033   整理番号：20A0764526

包括的in vivo質問はヒトエンハンサー変異体の表現型影響を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive In Vivo Interrogation Reveals Phenotypic Impact of Human Enhancer Variants

著者 (31件)： Kvon Evgeny Z. (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Zhu Yiwen (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Kelman Guy (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Novak Catherine S. (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Plajzer-Frick Ingrid (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Kato Momoe (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Garvin Tyler H. (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Pham Quan (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Harrington Anne N. (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Hunter Riana D. (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Godoy Janeth (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Meky Eman M. (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Akiyama Jennifer A. (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Afzal Veena (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Tran Stella (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Escande Fabienne (CHU Lille, University of Lille, EA7364, F-59000, Lille, France) ,  Gilbert-Dussardier Brigitte (CHU Poitiers, University of Poitiers, EA3808, F-86000, Poitiers, France) ,  Jean-Marcais Nolwenn (CHU Dijon Bourgogne, Department of Clinical Genetics, F-21000, Dijon, France) ,  Hudaiberdiev Sanjarbek (Computational Biology Branch, National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Ovcharenko Ivan (Computational Biology Branch, National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892, USA) ,  Dobbs Matthew B. (Department of Orthopaedic Surgery, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO 63110, USA) ,  Gurnett Christina A. (Department of Neurology, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO 63110, USA) ,  Manouvrier-Hanu Sylvie (CHU Lille, University of Lille, EA7364, F-59000, Lille, France) ,  Petit Florence (CHU Lille, University of Lille, EA7364, F-59000, Lille, France) ,  Visel Axel (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Visel Axel (U.S. Department of Energy Joint Genome Institute, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Visel Axel (School of Natural Sciences, University of California, Merced, CA 95343, USA) ,  Dickel Diane E. (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Pennacchio Len A. (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Pennacchio Len A. (U.S. Department of Energy Joint Genome Institute, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Pennacchio Len A. (Comparative Biochemistry Program, University of California, Berkeley, CA 94720, USA)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 180  号： 6  ページ： 1262-1271.e15  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非コード化変異体とヒト表現型の間の因果関係の確立は,増加する課題である。ここでは,in vivoでヒトエンハンサー変異体の病原性を評価するための高スループットマウスレポーター分析を紹介し,多指に繰り返されるエンハンサーにおける数千の変異体を調べた。原因として以前に提案された全ての稀な非コード変異体の71%が,それらの病原性役割と一致するパターンでレポーター遺伝子発現を誘導することを示した。エンハンサー活性を変化させることが観察された変異体は,さらにknockインマウスにおいて多指症を引き起こすことが確認された。また,組合せおよび単一ヌクレオチド変異誘発を用いて,エンハンサーのすべての位置に影響する突然変異のin vivo影響を評価し,ヒトではこれまで観察されなかった潜在的に病原性変異体を含む付加的機能置換を同定した。著者らの結果は,表現型関連エンハンサーにおける数百の突然変異の機能的結果を明らかにし,ヒトエンハンサー変異体の系統的なin vivo評価のための広く適用可能な戦略を確立する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 突然変異 ,  ヒト ,  *表現型 ,  病原性 ,  レポーター遺伝子
準シソーラス用語： 多指症 ,  ハイスループット ,  ヌクレオチド変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： シス調節要素 ,  エンハンサー ,  稀な非符号化バリアント ,  突然変異 ,  四肢の発達 ,  多指症 ,  CRISPR/Cas9 ,  ZRS ,  ソニックヘッジホッグ ,  ゲノム編集

分類 (2件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 質問 ,  ヒト ,  変異体 ,  表現型