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J-GLOBAL ID：202002219543193794   整理番号：20A2522746

サンプリングスキームとドリフトは構造によって推定される混合比率をバイアスできる【JST・京大機械翻訳】

Sampling schemes and drift can bias admixture proportions inferred by structure

著者 (4件)： Toyama Ken S. (Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Toronto, Toronto, ON, Canada) ,  Crochet Pierre-Andre (CEFE, CNRS, University of Montpellier, Universite Paul Valery Montpellier 3, EPHE, IRD, Montpellier, France) ,  Leblois Raphaeel (CBGP, INRAE, CIRAD, IRD, Montpellier SupAgro, University of Montpellier, Montpellier, France) ,  Leblois Raphaeel (Institut de Biologie Computationnelle, University of Montpellier, Montpellier, France)
資料名： Molecular Ecology Resources  (Molecular Ecology Resources)
巻： 20  号： 6  ページ： 1769-1785  発行年： 2020年 
JST資料番号： W2685A  ISSN： 1755-098X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝的に分化したが不完全に隔離された個体群から来る個体の交配は,生態学と進化に重要な意味を持つ混合集団の形成をもたらす。このシミュレーション研究において,著者らは,ソフトウェア構造によって推定した個々の混合割合が,異なる因子によって定量的に影響を受けるかを評価した。2つの発散個体群間の混和材の様々なシナリオを用いて,親集団からの不均衡サンプリングは,推定混合割合を深刻にバイアスするかもしれないことを見出した。さらに,混合母集団からの比例的に大きなサンプルは,推論の精度と精度を減少できる。予想されたように,混合事象後の親の個体群とドリフトの間の弱い分化は,不均等なサンプリングによって引き起こされたバイアスを強く増加させる。また,親集団が混合集団に等しく寄与しないとき,混合割合は一般的に偏ったことを示した。最後に,少数の例外を除いて,多数のマーカーを用いることは,それらのバイアスを低減するが,個々の祖先または非相関対立遺伝子モデルに対する代替事前は,ほとんどの状況における混合の推論にわずかしか影響しない。不均衡サンプリングは,特に少数のマーカーが使用されるとき,構造によって推定された混合割合において重要なバイアスを引き起こし,それらのバイアスは,親集団のドリフトと不等な遺伝的寄与の影響によって悪化する可能性があると結論した。したがって,経験的研究は,それらのサンプリング設計に注意して,このソフトウェアを使用するとき,混合個体群からの個体の祖先を推定するために,歴史的特性を考慮するべきである。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： シミュレーション ,  遺伝 ,  *ドリフト ,  混合比 ,  混和材料 ,  ソフトウェア ,  対立遺伝子 ,  生態学 ,  個体群 ,  バイアス ,  母集団

著者キーワード (5件)： 添加剤 ,  ドリフト ,  シミュレーション ,  構造 ,  不均衡サンプリング

分類 (1件)： 集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (5件)： サンプリング ,  スキーム ,  ドリフト ,  推定 ,  混合比率