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J-GLOBAL ID：202002220343893878   整理番号：20A0782432

メタボローム分析のための化学同位体標識液体クロマトグラフィー/質量分析における保持時間シフト分析と補正【JST・京大機械翻訳】

Retention time shift analysis and correction in chemical isotope labeling liquid chromatography/mass spectrometry for metabolome analysis

著者 (2件)： Li Yunong (Department of Chemistry, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada) ,  Li Liang (Department of Chemistry, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada)
資料名： Rapid Communications in Mass Spectrometry  (Rapid Communications in Mass Spectrometry)
巻： 34 Suppl S1  ページ： e8643  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0695A  ISSN： 0951-4198  CODEN： RCMSEF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 化学同位体標識(CIL)液体クロマトグラフィー/質量分析(LC/MS)メタボローム分析において,異なる試料から検出された同じ代謝産物のピーク対は,それらの質量と保持時間(RT)に従って配列される。許容窓の外側に落下する試料ファイルの一つにおけるピーク対のRTシフトは,異なる代謝産物として対のミスアラインメントをもたらす。したがって,いかなる有意なRTシフトの決定と補正は,高品質メタボローム結果の生成を確実にするために重要である。【方法】:CIL LC/MSにおいて,重同位体標識プール試料をすべての軽同位体標識の個々の試料にスパイクする。結果として,同じタイプの標識試料の分析において,多くの一般的代謝産物が全てのLC/MSランにおいて高い強度で検出された。内部RT参照マーカーとしてこれらの代謝産物のいくつかを選択する方法を開発し,LC/MS操作におけるRTシフトの発生をチェックした。有意なシフトが見られると,全LC RTウインドウをカバーするRT値を持つこれらのマーカーの拡張リストを選択し,RTシフトを修正するためにクロマトグラムを再較正する内部RT較正者として役立つ。【結果】RTチェック(RTC)と再較正(RT-calab)を実行するために,Rにおけるソフトウェアプログラムを開発した。このプログラムは,LC/MS実行においてユーザ定義閾値の外側にあるRTシフトの発生を迅速に決定することができ,それにより,問題を修正するためのタイムリーな介入(例えば小さな漏れを固定するか,またはカラムを変える)を引き起こす。ヒト尿試料の278ダンシル化LC/MSの分析において,RT値は30秒以内に補正できることを示した。結論:多くのメタボローム試料の運転中のRTシフトの迅速な検出と補正のために,CIL LC/MSメタボローム分析に適合したRTチェック法とプログラムを開発した。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 不整合 ,  代謝産物 ,  *LC-MS分析 ,  クロマトグラム ,  ダンシル化 ,  保持時間 ,  ヒト ,  ソフトウェア
準シソーラス用語： 高品質 ,  同位体標識 ,  *メタボローム , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 有機化合物の各種分析  (CC08034J) ,  生物薬剤学(基礎)  (GY01021U)

タイトルに関連する用語 (8件)： メタボローム ,  分析 ,  化学 ,  同位体標識 ,  液体クロマトグラフィー ,  質量分析 ,  保持時間 ,  シフト