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J-GLOBAL ID：202002220702360843   整理番号：20A0678339

ヒト気管支上皮HBE細胞におけるp53関連放射誘導発現長鎖非コードRNAの同定と生物機能予測分析【JST・京大機械翻訳】

Identification and bioinformatic function analysis of p53-related differentially expressed IncRNAs inγ-rays irradiated-human bronchial epithelial HBE cells

著者 (4件)： Hu Sai (南華大学公共衛生学院,湖南 衡陽,421001) ,  Huang Ruixue (中南大学公共衛生学院労動衛生与環境衛生学系,湖南 長沙,410078) ,  Zhou Pingkun (軍事科学院軍事医学研究院輻射医学研究所,北京市放射生物学重点実験室,北京 100850) ,  Huang Bo (南華大学公共衛生学院,湖南 衡陽,421001)
資料名： Zhongguo Yaolixue yu Dulixue Zazhi  (Zhongguo Yaolixue yu Dulixue Zazhi)
巻： 33  号： 8  ページ： 587-594  発行年： 2019年 
JST資料番号： C2292A  ISSN： 1000-3002  CODEN： ZYYZEW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:ヒト気管支上皮HBE細胞におけるp53関連のγ線誘導発現の長鎖非コードRNA(IncRNA)分子を鑑定し、p53に関連するIncRNA分子が放射線損傷反応、例えば上皮間充織転換における作用メカニズムの研究に情報を提供する。方法:CRISPR-Cas9遺伝子編集技術を用いてp53ノックアウトヒト気管支上皮細胞(HBEp53-/-)を構築し、Westernブロット法でP53発現レベルを測定し、IncRNAチップハイブリダイゼーションによりIncRNA発現スペクトルの変化を分析した。リアルタイム定量RT-PCR分析でIncRNA分子の発現変化を検証し、バイオインフォマティクス技術で差異変化IncRNAの生物学的機能を分析した。結果:野生型HBE細胞と比べ、HBEp53-/-細胞は照射後、239本のIncRNAが上方制御され、287本がダウンレギュレーションした。上方制御と下方制御発現の前の5つのIncRNAの差異発現変化はPCRによって検証された。バイオインフォマティクスGO分析によると、前10位に差次的に発現するIncRNAの標的遺伝子は、主にβ3アドレナリン受容体結合蛋白質、チロシンキナーゼ活性タンパク質、DNA結合蛋白質、亜鉛イオン膜貫通トランスポータータンパク質、シナプス融合タンパク質結合タンパク質とユビキチン結合タンパク質などの分子機能に関与する。KEGG分析によると、IncRNAの標的遺伝子機能を差次的に発現する生体系は主に感知、神経、免疫、内分泌、環境適応、発育と循環システムなどに関与する。結論:ヒト気管支上皮HBE細胞においてp53に関連する放射誘導IncRNA分子を同定し、バイオインフォマティクス予測により、これらのIncRNA分子は細胞照射応答過程において、多種の生理機能に関与し、複数の機能シグナル経路に関与することが分かった。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 融合タンパク質 ,  アップレギュレーション ,  ユビキチン ,  *p53タンパク質 ,  内分泌 ,  チロシンキナーゼ ,  ダウンレギュレーション ,  生物活性 ,  *ヒト ,  ウェスタンブロット法 ,  野生型 ,  間充織 ,  シナプス ,  *上皮 ,  RT-PCR法

分類 (3件)： 有機化合物の毒性  (GZ02030Y) ,  呼吸器の基礎医学  (GI01020H) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

タイトルに関連する用語 (11件)： ヒト ,  気管支上皮 ,  細胞 ,  p53 ,  放射 ,  誘導発現 ,  長鎖非コードRNA ,  同定 ,  生物 ,  予測 ,  分析