抗体-インテグリン複合体の結合姿勢を予測するためのガイドライン【JST・京大機械翻訳】

Chaves Beatriz; Sartori Geraldo R.; Vasconcelos Disraeli C. A.; Savino Wilson; Caffarena Ernesto R.; Cotta-de-Almeida Vinicius; da Silva Joao H. M.

文献

J-GLOBAL ID：202002220860156472 整理番号：20A1935083

抗体-インテグリン複合体の結合姿勢を予測するためのガイドライン【JST・京大機械翻訳】

Guidelines To Predict Binding Poses of Antibody-Integrin Complexes

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資料名：
巻： 5 号： 27 ページ： 16379-16385 発行年： 2020年
JST資料番号： W5044A ISSN： 2470-1343 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

インテグリンは細胞膜を横切る双方向シグナルを伝達する細胞接着受容体である。それらは2つのサブユニットから成る非共有結合性結合ヘテロ二量体分子であり,いくつかの病理学におけるバイオマーカーとして作用する。したがって,治療抗体産生の増加により,抗インテグリン抗体を生産するためにいくつかの努力が適用されてきた。ここでは,蛋白質-蛋白質ドッキングと分子動力学シミュレーションにより,インテグリン-抗体複合体の結合姿勢の生成と同定の方法を評価し,最終モデルの信頼度を保証し,偽陽性姿勢を避ける戦略を提案した。結果は,ClusProとGRAMM-Xが,インテグリン-抗体複合体の天然姿勢を生成する最良のプログラムであることを示した。さらに,選択した姿勢が単純なルールを用いてネイティブなものであることを確実にした。第1のモデルが最低エネルギーを持つClusProからのすべての錯体が,第2のものより少なくとも5%以上,正確に予測された。したがって,著者らの方法論は,インテグリン-抗体複合体に対する誤った姿勢の誤飲を回避するのに有効であると思われる。規則が決定的でない場合において,著者らは,RMSDi<0.5nmによって特徴づけられたネイティブ姿勢を同定するために,加熱分子動力学の使用を提案した。ここに示した方法のセットは抗インテグリン抗体の合理的設計を助け,新しいバイオ医薬品の開発に関する洞察を与えた。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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細胞生理一般 , 生物学的機能

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