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J-GLOBAL ID：202002221311341808   整理番号：20A2042594

正常および癌性胃腸組織における遺伝子発現プロファイルに基づく腫瘍抑制遺伝子の計算同定【JST・京大機械翻訳】

Computational Identification of Tumor Suppressor Genes Based on Gene Expression Profiles in Normal and Cancerous Gastrointestinal Tissues

著者 (10件)： Sun Qingrong (Department of Basic Medicine, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Sun Qingrong (Cancer Genomics Research Center, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Uddin Md. Nazim (Cancer Genomics Research Center, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Uddin Md. Nazim (Biomedical Informatics Research Lab, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Li Mengyuan (Cancer Genomics Research Center, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Li Mengyuan (Biomedical Informatics Research Lab, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Wang Xiaosheng (Cancer Genomics Research Center, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Wang Xiaosheng (Biomedical Informatics Research Lab, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Lai Maode (Department of Basic Medicine, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Lai Maode (Cancer Genomics Research Center, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China)
資料名： Journal of Oncology (Web)  (Journal of Oncology (Web))
巻： 2020  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7781A  ISSN： 1687-8450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 癌は,食道,胃および結腸のような種々の胃腸(GI)器官で優勢である。しかし,小腸は非常に低い癌リスクを有する。異なるGI組織間の癌発生率の有意差を説明できる分子キューを調べることは興味深い。いくつかの大規模正常および癌組織ゲノムデータセットを用いて,小腸と他のGI組織およびGI癌と正常組織の間の遺伝子発現プロファイリングを比較した。17の腫瘍抑制遺伝子(TSG)を同定し,他のGI組織より小腸で有意に高い発現レベルを示し,正常組織よりGI癌で有意に低い発現レベルを示した。これらのTSGは主に代謝,免疫及び細胞増殖シグナル伝達関連経路に関与した。多くのTSGは,種々の癌における生存予後と陽性発現相関を有し,それらの腫瘍抑制機能を確認した。多くのTSGのダウンレギュレーションは,癌における過メチル化と関連することを示した。さらに,多くのTSGの発現は腫瘍純度と逆相関し,種々の癌における抗腫瘍免疫応答と正相関し,これらのTSGが抗腫瘍免疫を促進することにより腫瘍抑制機能を発揮することを示唆した。さらに,TSGとそれらのマスター転写調節因子(MTRs)の転写調節ネットワークを同定した。多くのMTRsは,HNF4A,ZBTB7A,p53,およびRUNX3のような腫瘍抑制因子として認識されてきた。TSGは腫瘍形成および腫瘍発生に関連する新しい分子手がかりを提供し,癌診断,予後および治療に対する潜在的臨床的意味合いを有する。Copyright 2020 Qingrong Sun et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結腸 ,  *腫瘍 ,  小腸 ,  細胞増殖 ,  予後 ,  細胞情報伝達 ,  ダウンレギュレーション ,  *癌抑制遺伝子 ,  腫瘍免疫 ,  腫瘤形成
準シソーラス用語： 癌診断 ,  腫瘍組織 ,  *腫瘍抑制 ,  過メチル化 ,  腫瘍抑制因子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  消化器の腫よう  (GH04000D) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

引用文献 (47件)：

• R. L. Siegel, K. D. Miller, A. Jemal, "Cancer Statistics, 2019," CA: A Cancer Journal for Clinicians, vol. 69, no. 1, pp. 7-34, 2019.
• G. T. Consortium, "The genotype-tissue expression (GTEx) project," Nature Genetics, vol. 45, no. 6, pp. 580-585, 2013.
• R. Edgar, M. Domrachev, A. E. Lash, "Gene Expression Omnibus: NCBI gene expression and hybridization array data repository," Nucleic Acids Research, vol. 30, no. 1, pp. 207-210, 2002.
• T. Nathanson, A. Ahuja, A. Rubinsteyn et al., "Somatic mutations and neoepitope homology in melanomas treated with CTLA-4 blockade," Cancer Immunology Research, vol. 5, no. 1, pp. 84-91, 2017.
• W. Roh, P. L. Chen, A. Reuben et al., "Integrated molecular analysis of tumor biopsies on sequential CTLA-4 and PD-1 blockade reveals markers of response and resistance," Science Translational Medicine, vol. 9, no. 379, 2017.

タイトルに関連する用語 (6件)： 癌 ,  組織 ,  遺伝子発現プロファイル ,  腫瘍抑制遺伝子 ,  計算 ,  同定