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J-GLOBAL ID：202002221476607381   整理番号：20A0576254

2019新規コロナウイルスのゲノム特性化と疫学:ウイルス起源と受容体結合に対する意味【JST・京大機械翻訳】

Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding

著者 (42件)： Lu Roujian (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Zhao Xiang (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Li Juan (Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong, Shandong First Medical University and Shandong Academy of Medical Sciences, Tai’an, China) ,  Niu Peihua (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Yang Bo (Division for Viral Disease Detection, Hubei Provincial Center for Disease Control and Prevention, Wuhan, China) ,  Wu Honglong (BGI PathoGenesis Pharmaceutical Technology, Shenzhen, China) ,  Wang Wenling (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Song Hao (Research Network of Immunity and Health (RNIH), Beijing Institutes of Life Science, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Huang Baoying (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Zhu Na (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Bi Yuhai (Chinese Academy of Sciences Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Bi Yuhai (Center for Influenza Research and Early-warning (CASCIRE), CAS-TWAS Center of Excellence for Emerging Infectious Diseases (CEEID), Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Ma Xuejun (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Zhan Faxian (Division for Viral Disease Detection, Hubei Provincial Center for Disease Control and Prevention, Wuhan, China) ,  Wang Liang (Chinese Academy of Sciences Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Wang Liang (Center for Influenza Research and Early-warning (CASCIRE), CAS-TWAS Center of Excellence for Emerging Infectious Diseases (CEEID), Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Hu Tao (Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong, Shandong First Medical University and Shandong Academy of Medical Sciences, Tai’an, China) ,  Zhou Hong (Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong, Shandong First Medical University and Shandong Academy of Medical Sciences, Tai’an, China) ,  Hu Zhenhong (Central Theater, People’s Liberation Army General Hospital, Wuhan, China) ,  Zhou Weimin (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Zhao Li (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Chen Jing (Key Laboratory of Laboratory Medicine, Ministry of Education, and Zhejiang Provincial Key Laboratory of Medical Genetics, Institute of Medical Virology, School of Laboratory Medicine and Life Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou, China) ,  Meng Yao (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Wang Ji (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Lin Yang (BGI PathoGenesis Pharmaceutical Technology, Shenzhen, China) ,  Yuan Jianying (BGI PathoGenesis Pharmaceutical Technology, Shenzhen, China) ,  Xie Zhihao (BGI PathoGenesis Pharmaceutical Technology, Shenzhen, China) ,  Ma Jinmin (BGI PathoGenesis Pharmaceutical Technology, Shenzhen, China) ,  Liu William J (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Wang Dayan (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Xu Wenbo (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Holmes Edward C (Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Life and Environmental Sciences and School of Medical Sciences, University of Sydney, Sydney, NSW, Australia) ,  Gao George F (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Gao George F (Chinese Academy of Sciences Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Gao George F (Center for Influenza Research and Early-warning (CASCIRE), CAS-TWAS Center of Excellence for Emerging Infectious Diseases (CEEID), Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Wu Guizhen (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Chen Weijun (BGI PathoGenesis Pharmaceutical Technology, Shenzhen, China) ,  Shi Weifeng (Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong, Shandong First Medical University and Shandong Academy of Medical Sciences, Tai’an, China) ,  Shi Weifeng (The First Affiliated Hospital of Shandong First Medical University (Shandong Provincial Qianfoshan Hospital), Jinan, China) ,  Tan Wenjie (NHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Tan Wenjie (Central Theater, People’s Liberation Army General Hospital, Wuhan, China) ,  Tan Wenjie (Center for Biosafety Mega-Science, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China)
資料名： Lancet  (Lancet)
巻： 395  号： 10224  ページ： 565-574  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0673A  ISSN： 0140-6736  CODEN： LANCA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 2019年12月後半に,未同定の微生物薬によるウイルス性肺炎を呈する患者が中国武漢市で報告された。新しいコロナウイルスを引き続いて原因病原体として同定し,暫定的に2019の新規コロナウイルス(2019-nCoV)と命名した。2019-nCoV感染症の2000例以上が確認されており,それらの多くは武漢に住んでいるか,またはヒトから人間への伝達が確認されていることが確認されている。著者らは,9人の入院患者からの気管支肺胞洗浄液および培養分離株からのサンプルの次世代配列決定を行い,そのうち8人は武漢におけるHuanan海産物市場を訪れた。これらの個体から完全および部分的な2019-nCoVゲノム配列を得た。cDNA末端の迅速増幅により決定された末端領域を持つ完全長ゲノムを得るために,Sanger配列決定を用いてウイルスコンティグを連結した。これらの2019-nCoVゲノムと他のコロナウイルスの系統発生分析を用いて,ウイルスの進化史を決定し,その起源を推論した。相同性モデリングを行い,ウイルスの受容体結合特性を調べた。9人の患者から得られた2019-nCoVの10のゲノム配列は非常に類似しており,99以上の98%以上の配列同一性を示した。特に,2019-nCoVは,中国東部のZhoushanにおいて2018年に収集された2つのBAT由来重症急性呼吸症候群(SARS)様コロナウイルス,bat-SL-CoVZC45およびbat-SL-CoVZXC21と密接に関連していた(約79%)およびMERS-CoV(約50%)。系統発生分析により,2019-nCoVはBetacoronavirus属の亜属Sarcebovirus内にあり,比較的長い枝長を持ち,その最も近縁な近縁種である-SL-CoVZC45およびbat-SL-CoVZXC21に属し,SARS-CoVとは遺伝的に異なることを明らかにした。特に,相同性モデリングにより,2019-nCoVは,いくつかの重要な残基におけるアミノ酸変異にもかかわらず,SARS-CoVのそれと類似の受容体結合ドメイン構造を有することを明らかにした。2019-nCoVはSARS-CoVから十分に分岐しており,新しいヒト感染性ベタロナウイルスと考えられている。我々の系統発生分析は,コウモリがこのウイルスの元の宿主であるかもしれないが,武漢の海産物市場で販売された動物は,ヒトにおけるウイルスの出現を促進する中間宿主を代表する可能性があることを示唆する。重要なことに,構造解析は,2019-nCoVがヒトのアンギオテンシン変換酵素2受容体に結合できることを示唆する。このウイルスの将来の進化,適応および普及は緊急の研究を必要とする。中国の国家Key研究開発計画,中国における中国,中国科学院,山東第一医科大学,中国における感染症の予防と予防のための国家Majorプロジェクト。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ゲノム ,  微生物 ,  配列相同性 ,  cDNA ,  *疫学 ,  コウモリ ,  *受容体 ,  気管支肺胞洗浄液 ,  遺伝 ,  動物 ,  病原体 ,  *太陽コロナ ,  ヒト ,  ウイルス性肺炎 ,  感染症

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  疫学  (GB03000E)

タイトルに関連する用語 (8件)： コロナウイルス ,  ゲノム ,  特性化 ,  疫学 ,  ウイルス ,  起源 ,  受容体結合 ,  意味