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J-GLOBAL ID：202002221687035859   整理番号：20A2159279

環境DNAメタバーコーディング結果を正確に解釈するエラーの同定:乾燥ゾーン水穴における脊椎動物を検出するための事例研究【JST・京大機械翻訳】

Identifying error and accurately interpreting environmental DNA metabarcoding results: A case study to detect vertebrates at arid zone waterholes

著者 (3件)： Furlan Elise M. (Institute for Applied Ecology, University of Canberra, Bruce, ACT, Australia) ,  Davis Jenny (Research Institute for Environment and Livelihoods, College of Engineering, IT and Environment, Charles Darwin University, Casuarina, NT, Australia) ,  Duncan Richard P. (Institute for Applied Ecology, University of Canberra, Bruce, ACT, Australia)
資料名： Molecular Ecology Resources  (Molecular Ecology Resources)
巻： 20  号： 5  ページ： 1259-1276  発行年： 2020年 
JST資料番号： W2685A  ISSN： 1755-098X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 環境DNA(eDNA)メタバーコーディング調査により,局所生物多様性の特性化から食品-Web相互作用を同定する広い応用を有する微量試料からの分類群の迅速,非侵襲的同定が可能になった。しかし,この技術は,2つの主要な源から,(a)ワークフローに入る外来DNAによる汚染,および(b)ワークフロー内のDNAの誤同定,から誤差を起こしやすい。両タイプのエラーは,真の分類群存在を不明瞭にするか,あるいはサンプルサイトに存在する分類群を不正確に同定することによって分類学的豊かさを増加させる可能性があるが,多重誤差源はメタバーコーディング研究においては説明されないままである。ここでは,オーストラリアの乾燥地帯における水穴で脊椎動物種を検出するために設計されたeDNAメタバーコード研究からのデータを用いて,ワークフロー誤差がいかに起こるか,またこれらの誤差を緩和する方法を説明した。著者らは,水穴からの水サンプルにおける34科,19目および5つの脊椎動物クラスにわたる36分類群のDNAを検出し,遠隔地における迅速,非侵襲的検出,および水生から陸生分類群までの広い試料分類学的多様性を提供するためのeDNAメタバーコーディング調査の可能性を実証した。しかし,著者らは最初に,サンプルにおける152の分類群を同定して,多くの偽陽性検出があった。これらの誤差の源を同定し,誤差を検出し,除去するための段階的プロセスを設計し,他のメタバーコーディング研究において生じるような類似の誤差を最小化するためのテンプレートを提供した。著者らの知見は,eDNAメタバーコーディング調査が,それらの精度を確実にするための誤差のために注意深く行われ,スクリーニングする必要があることを示唆する。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  食品 ,  *DNA【核酸】 ,  *脊椎動物 ,  オーストラリア連邦 ,  *事例研究 ,  水試料 ,  *乾燥地帯 ,  生物多様性 ,  Web【情報システム】 ,  ワークフロー
準シソーラス用語： 非侵襲 ,  分類学 ,  分類群 ,  陸生 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 乾燥地帯の生物多様性 ,  eDNAメタバーコーディング ,  偽検出 ,  偽陽性 ,  陸生動物相 ,  I型エラー

分類 (1件)： 遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (8件)： 環境DNA ,  メタバーコーディング ,  エラー ,  同定 ,  乾燥ゾーン ,  水 ,  脊椎動物 ,  研究