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J-GLOBAL ID：202002221716494146   整理番号：20A1282745

新規コロナウイルスSARS-CoV-2の変異と進化分析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of variation and evolution of SARS-CoV-2 genome

著者 (6件)： Zhou Yezhen (南方医科大学公共衛生学院三級生物安全実験室,广東 广州,510515) ,  Zhang Shihao (南方医科大学公共衛生学院三級生物安全実験室,广東 广州,510515) ,  Chen Jiayi (南方医科大学公共衛生学院三級生物安全実験室,广東 广州,510515) ,  Wan Chengsong (南方医科大学公共衛生学院三級生物安全実験室,广東 广州,510515) ,  Zhao Wei (南方医科大学公共衛生学院三級生物安全実験室,广東 广州,510515) ,  Zhang Bao (南方医科大学公共衛生学院三級生物安全実験室,广東 广州,510515)
資料名： Nanfang Yike Daxue Xuebao  (Nanfang Yike Daxue Xuebao)
巻： 40  号： 2  ページ： 152-158  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2216A  ISSN： 1673-4254  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】新規コロナウイルスSARS-CoV-2の進化と変異を分析する。方法:GISAID、NCBIから関連ウイルス全ゲノム配列をダウンロードし、バイオインフォマティクスソフトウェアMEGA-X、BEAST、TempEstなどのソフトウェアを用いて、ゲノム進化ツリーを構築し、ウイルスの時間進化シグナルを推測し、ウイルス出現のtMRCA時間を計算した。ウイルス進化の選択圧力を分析した。【結果】ゲノム系統樹は,SARS-CoV-2が,コウモリコロナウイルスBetaCoV/bat/Yunnan/RaTG13/2013,bat-SL-CoVZC45,およびBeta-CoVZC45と,BetaCoV/bat/Yunnan/RaTG13/2013,bat-SL-CoVZC45であることを示した。bat-SL-CoVZXC21及びSARS-CoVなどのウイルスは,コロナウイルスβ属のSarbecovirus亜属を構成する。現在のウイルス配列は微弱な時間進化信号があり、tMRCAの平均時間は73d、95%信頼区間(38.9119.3d)であり、BetaCoV/bat/Yunnan/RaTG13/2013ウイルスとは正性時間進化シグナルを持たなかった。bat-SL-CoVZC45とSARS-CoVは強い正の時間進化関係を持つ。ウイルスは流行中に変異があり、主に浄化選択圧力である。結論:ウイルスSARS-CoV-2は2019年11月頃に出現し、コウモリ関連コロナウイルスに由来する。【結果】ウイルスSARS-CoV-2のトレーサビリティと進化の研究は,病気の正しい予防と制御に有益である。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 系統樹 ,  ゲノム ,  ソフトウェア ,  トレーサビリティ ,  *コウモリ ,  時間発展 ,  フダンソウ属
準シソーラス用語： *コロナウイルス ,  *SARSウイルス ,  ゲノム配列 ,  ウイルス進化 ,  ゲノム進化 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (4件)： コロナウイルス ,  変異 ,  進化 ,  分析