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J-GLOBAL ID：202002221858124643   整理番号：20A0427425

ライゲーション支援分化によるmRNA中のN1-メチルアデノシンの定量化と単一塩基分解能分析【JST・京大機械翻訳】

Quantification and Single-Base Resolution Analysis of N1-Methyladenosine in mRNA by Ligation-Assisted Differentiation

著者 (6件)： Ding Jiang-Hui (Key Laboratory of Analytical Chemistry for Biology and Medicine (Ministry of Education), Sauvage Center for Molecular Sciences, Department of Chemistry, Wuhan University, People’s Republic of China) ,  Ma Cheng-Jie (Key Laboratory of Analytical Chemistry for Biology and Medicine (Ministry of Education), Sauvage Center for Molecular Sciences, Department of Chemistry, Wuhan University, People’s Republic of China) ,  Chen Meng-Yuan (Key Laboratory of Analytical Chemistry for Biology and Medicine (Ministry of Education), Sauvage Center for Molecular Sciences, Department of Chemistry, Wuhan University, People’s Republic of China) ,  Chen Bei (Key Laboratory of Analytical Chemistry for Biology and Medicine (Ministry of Education), Sauvage Center for Molecular Sciences, Department of Chemistry, Wuhan University, People’s Republic of China) ,  Yuan Bi-Feng (Key Laboratory of Analytical Chemistry for Biology and Medicine (Ministry of Education), Sauvage Center for Molecular Sciences, Department of Chemistry, Wuhan University, People’s Republic of China) ,  Feng Yu-Qi (Key Laboratory of Analytical Chemistry for Biology and Medicine (Ministry of Education), Sauvage Center for Molecular Sciences, Department of Chemistry, Wuhan University, People’s Republic of China)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 92  号： 3  ページ： 2612-2619  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： N1-メチルアデノシン(m1A)のようなRNA修飾はRNAの二次構造及び特異的リーダー蛋白質を認識する能力に影響する。部位特異的m~1Aを検出する方法は,要求されている。ここでは,単一塩基分解能を有するmRNAにおけるm~1Aの定量的検出のための連結支援分化アプローチを報告する。m~1Aにおけるメチル基はウリジンとのWatson-Crick塩基対形成を破壊し,ある種のリガーゼのより低い連結効率とより低い量の連結生成物をもたらした。定量的リアルタイムPCRを用いたライゲーション生成物の検出は,m~1Aの部位特異的評価を提供した。最初に,適切なリガーゼをスクリーニングし,T3 DNAリガーゼがm1Aとアデノシンの間の最良の識別を提供することを見出した。HEK293T細胞から2(BRD2)mRNAを含むブロモドメインの1674位にm~1Aを検出し,定量した。肺癌組織において,BRD2 mRNAの1674位のm1Aレベルは,腫瘍隣接正常組織と比較して有意に減少し,部位特異的m1Aが発癌に関与している可能性が示唆された。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *分化 ,  発癌 ,  分解能 ,  *RNA【核酸】 ,  DNA【核酸】 ,  二次構造 ,  リガーゼ ,  肺腫瘍 ,  *mRNA ,  タンパク質 ,  腫瘍 ,  診断用薬 ,  プリンヌクレオシド ,  リボヌクレオシド ,  ピリミジンヌクレオシド
準シソーラス用語： ブロモドメイン ,  メチル基 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  有機化合物の物理分析  (CC03034A) ,  液体クロマトグラフィー  (CC04014L) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

物質索引 (2件)： アデノシン ,  ウリジン

タイトルに関連する用語 (8件)： ライゲーション ,  支援 ,  分化 ,  mRNA ,  定量化 ,  塩基 ,  分解能 ,  分析