細胞情報伝達における情報損失を推定するための分子通信理論の応用  癌トランスクリプトミクスに基づくアプローチ【JST・京大機械翻訳】

Sakkaff Zahmeeth; Immaneni Aditya; Pierobon Massimiliano

文献

J-GLOBAL ID：202002222733981907 整理番号：20A1946200

細胞情報伝達における情報損失を推定するための分子通信理論の応用癌トランスクリプトミクスに基づくアプローチ【JST・京大機械翻訳】

Applying molecular communication theory to estimate information loss in cell signal transduction an approach based on cancer transcriptomics

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号： NANOCOM ’18 ページ： 1-7 発行年： 2018年
JST資料番号： D0698C 資料種別：会議録 (C)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

シグナル伝達経路は,生物細胞に埋め込まれた化学通信チャンネルであり,それらは,他の細胞の挙動の中で,細胞増殖と増殖を調節するために環境から情報を伝播する。これらのチャンネルの正常な機能における破壊は,主に根底にある遺伝的コードの突然変異から生じ,癌のような疾患の原因になる。細胞組織サンプルにおける遺伝的コード発現,すなわち,トランスクリプトミクス,および分子通信の新興分野に関する公開データのアベイラビリティ増加によって動機づけられて,実験データマイニングと通信理論に基づく新規データ駆動方式をこの論文で提案する。このアプローチは,癌との関連でこれらの経路の既存の計算モデルの代替法であり,それはしばしば根底にある機構の複雑性を単純化するように見える。対照的に,コンピュータ方法論をここで導き,トランスクリプトミクスデータのみに基づいて,健康および疾患細胞における情報伝達経路の情報伝播性能の差を推定した。この方法論を,経路を介した情報フローの分子通信抽象化および基礎となるDNA遺伝子の発現との相関により構築した。腎臓癌におけるJAK-STAT経路に基づく事例研究について数値結果を示し,利用可能なデータにおける経路遺伝子変異の発生と相関した。Please refer to this article’s citation page on the publisher website for specific rights information. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現 , 分子・遺伝情報処理

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細胞情報伝達における情報損失を推定するための分子通信理論の応用 癌トランスクリプトミクスに基づくアプローチ【JST・京大機械翻訳】

細胞情報伝達における情報損失を推定するための分子通信理論の応用癌トランスクリプトミクスに基づくアプローチ【JST・京大機械翻訳】