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J-GLOBAL ID：202002223460210541   整理番号：20A1815063

RNA-seq解析は,コビア,Rachycentron canadumにおける超および低塩分に対する多様な適応応答を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

RNA-seq analysis reveals divergent adaptive response to hyper- and hypo-salinity in cobia, Rachycentron canadum

著者 (10件)： Cao Danyu (Department of Aquaculture, College of Fisheries Guangdong Ocean University, Zhanjiang, Guangdong, People’s Republic of China) ,  Li Jinfeng (Department of Aquaculture, College of Fisheries Guangdong Ocean University, Zhanjiang, Guangdong, People’s Republic of China) ,  Huang Baosong (Department of Aquaculture, College of Fisheries Guangdong Ocean University, Zhanjiang, Guangdong, People’s Republic of China) ,  Zhang Jiandong (Department of Aquaculture, College of Fisheries Guangdong Ocean University, Zhanjiang, Guangdong, People’s Republic of China) ,  Pan Chuanhao (Department of Aquaculture, College of Fisheries Guangdong Ocean University, Zhanjiang, Guangdong, People’s Republic of China) ,  Huang Jiansheng (Department of Aquaculture, College of Fisheries Guangdong Ocean University, Zhanjiang, Guangdong, People’s Republic of China) ,  Zhou Hui (Department of Aquaculture, College of Fisheries Guangdong Ocean University, Zhanjiang, Guangdong, People’s Republic of China) ,  Ma Qian (Department of Aquaculture, College of Fisheries Guangdong Ocean University, Zhanjiang, Guangdong, People’s Republic of China) ,  Chen Gang (Department of Aquaculture, College of Fisheries Guangdong Ocean University, Zhanjiang, Guangdong, People’s Republic of China) ,  Wang Zhongliang (Department of Aquaculture, College of Fisheries Guangdong Ocean University, Zhanjiang, Guangdong, People’s Republic of China)
資料名： Fish Physiology and Biochemistry  (Fish Physiology and Biochemistry)
巻： 46  号： 5  ページ： 1713-1727  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1932A  ISSN： 0920-1742  CODEN： FPBIEP  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 塩分は,海洋魚の代謝および生理活性,品種,発育および成長に影響する重要な非生物的ストレスである。研究は,ユーカリ(Rachycentron canadum),ユーリハリン海洋硬骨魚,が迅速で効果的な高/低イオノ-および浸透圧調節の能力を有することを示した。しかし,この種に関するゲノム研究は不足しており,塩分調節に関与する遺伝子を同定するためのトランスクリプトームレベルでは研究されておらず,塩分の変動への適応の基礎となる基本的機構の理解に影響を与える。異なる塩分レベルに対するコビアの分子応答を記述するために,RNA-seq分析を用いて塩分変化に応答する遺伝子および生物学的過程を同定した。本研究では,395,080,114の清潔な読取りを作成し,次に2758bpのN50サイズを有する65,318の単遺伝子に組み立てた。20,671は,低塩分に順応した8805の遺伝子および高塩分に適応した11,866の遺伝子を含む,有意に異なる発現遺伝子(DEG)があった。これらのDEGはステロイド生合成,不飽和脂肪酸代謝,グルタチオン代謝,エネルギー代謝,浸透圧調節及び免疫応答において高度に発現した。コビアで同定された候補遺伝子は,海洋魚における塩分適応の分子機構を研究するための貴重な情報を提供する。さらに,トランスクリプトミクス配列決定データは,新規遺伝子の同定のための重要な資源だけでなく,コビア生物学に関するさらなる研究にも作用する。Copyright Springer Nature B.V. 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生合成 ,  不飽和脂肪酸 ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  免疫反応 ,  *塩分 ,  海洋 ,  硬骨魚類 ,  生物活性 ,  ユーカリ ,  トランスクリプトーム ,  脂肪族アミン ,  チオール ,  脂肪族カルボン酸 ,  トリペプチド ,  含硫アミノ酸
準シソーラス用語： 候補遺伝子 ,  非生物的ストレス ,  *RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： トランスクリプトーム ,  塩分適応 ,  Rachycentron canadum ,  RNA-seq ,  差次的遺伝子発現

分類 (1件)： 魚類  (FH02020K)

物質索引 (1件)： グルタチオン

タイトルに関連する用語 (4件)： RNA-seq ,  解析 ,  塩分 ,  適応応答