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J-GLOBAL ID：202002223798153911   整理番号：20A2512225

皮膚黒色腫の予後の指標としてのRNA結合蛋白質の突然変異により駆動された異常なRNAスプライシングイベント【JST・京大機械翻訳】

Aberrant RNA Splicing Events Driven by Mutations of RNA-Binding Proteins as Indicators for Skin Cutaneous Melanoma Prognosis

著者 (12件)： Mei Chao (Department of Clinical Pharmacology, Hunan Key Laboratory of Pharmacogenetics, Key Laboratory of Biological Nanotechnology of National Health Commission, and National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Mei Chao (Engineering Research Center for Applied Technology of Pharmacogenomics of Ministry of Education, Institute of Clinical Pharmacology, Central South University, Changsha, China) ,  Song Pei-Yuan (Department of Clinical Pharmacology, Hunan Key Laboratory of Pharmacogenetics, Key Laboratory of Biological Nanotechnology of National Health Commission, and National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Song Pei-Yuan (Engineering Research Center for Applied Technology of Pharmacogenomics of Ministry of Education, Institute of Clinical Pharmacology, Central South University, Changsha, China) ,  Zhang Wei (Department of Clinical Pharmacology, Hunan Key Laboratory of Pharmacogenetics, Key Laboratory of Biological Nanotechnology of National Health Commission, and National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Zhang Wei (Engineering Research Center for Applied Technology of Pharmacogenomics of Ministry of Education, Institute of Clinical Pharmacology, Central South University, Changsha, China) ,  Zhou Hong-Hao (Department of Clinical Pharmacology, Hunan Key Laboratory of Pharmacogenetics, Key Laboratory of Biological Nanotechnology of National Health Commission, and National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Zhou Hong-Hao (Engineering Research Center for Applied Technology of Pharmacogenomics of Ministry of Education, Institute of Clinical Pharmacology, Central South University, Changsha, China) ,  Li Xi (Department of Clinical Pharmacology, Hunan Key Laboratory of Pharmacogenetics, Key Laboratory of Biological Nanotechnology of National Health Commission, and National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Li Xi (Engineering Research Center for Applied Technology of Pharmacogenomics of Ministry of Education, Institute of Clinical Pharmacology, Central South University, Changsha, China) ,  Liu Zhao-Qian (Department of Clinical Pharmacology, Hunan Key Laboratory of Pharmacogenetics, Key Laboratory of Biological Nanotechnology of National Health Commission, and National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Liu Zhao-Qian (Engineering Research Center for Applied Technology of Pharmacogenomics of Ministry of Education, Institute of Clinical Pharmacology, Central South University, Changsha, China)
資料名： Frontiers in Oncology (Web)  (Frontiers in Oncology (Web))
巻： 10  ページ： 568469  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7089A  ISSN： 2234-943X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 皮膚黒色腫(SKCM)の世界的な発生率は,他の腫瘍より迅速な速度で増加している。異常なオルタナティブスプライシング(AS)は癌において一般的である。しかし,この過程が癌の予後にどのように寄与するかは,まだほとんど知られていない。RNA結合蛋白質(RBP)の変異はスプライシング過程で大きな変化を誘発する可能性がある。この研究では,RBP変異により誘導されるスプライシングパターンの広範な変化と共に,SKCM患者のDNAとRNA配列決定データと臨床情報を包括的に分析した。RBPsにおけるmRNA発現関連および予後関連変異をスクリーニングし,スプライシングパターンに対するRBP変異の潜在的影響を検討した。853のRBPsの変異は,スプライシング異常(p<0.01)と相関していることが示された。機能的濃縮分析は,これらの選択的スプライシング事象(ASEs)が,癌における修飾過程,細胞周期チェックポイント,代謝経路,MAPKシグナル伝達,PI3K-Aktシグナル伝達および他の重要な経路を調節することにより,腫瘍進行に関与する可能性があることを明らかにした。また,RBP変異により影響される全生存関連AS事象(OS-ASE)に基づく予測モデルを構築し,0.989の曲線下面積で良好な予測効率を示した。この研究は,スプライシング変化におけるRBP変異の重要性を明らかにし,SKCMの予後予測に対する効果的なバイオマーカーを提供する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  *RNA【核酸】 ,  腫瘍 ,  *突然変異 ,  代謝経路 ,  *予後 ,  細胞情報伝達 ,  選択的スプライシング ,  バイオマーカー ,  予測モデル ,  ホスファチジルイノシトール3-キナーゼ ,  *RNA結合タンパク質
準シソーラス用語： 腫瘍進行 ,  予後予測 ,  mRNA発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 皮膚黒色腫 ,  RNA結合蛋白質 ,  突然変異 ,  選択的スプライシング ,  予後

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (84件)：

• GuyGPJrMachlinSREkwuemeDUYabroffKR. Prevalence and costs of skin cancer treatment in the U.S., 2002-2006 and 2007-2011. Am J Prev Med. (2015) 48:183-7. doi: 10.1016/j.amepre.2014.08.03625442229
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• CaoAYHuangJHuZLiWFMaZLTangLL. The prevalence of PALB2 germline mutations in BRCA1/BRCA2 negative Chinese women with early onset breast cancer or affected relatives. Breast Cancer Res Treat. (2009) 114:457-62. doi: 10.1007/s10549-008-0036-z
• CaoAYHuangJHuZLiWFMaZLTangLL. Mutation analysis of BRIP1/BACH1 in BRCA1/BRCA2 negative Chinese women with early onset breast cancer or affected relatives. Breast Cancer Res Treat. (2009) 115:51-5. doi: 10.1007/s10549-008-0052-z

タイトルに関連する用語 (7件)： 皮膚黒色腫 ,  予後 ,  指標 ,  RNA結合蛋白質 ,  突然変異 ,  RNAスプライシング ,  イベント