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J-GLOBAL ID：202002223925700524   整理番号：20A0282424

農場動物のゲノムにおける連鎖不平衡の程度について【JST・京大機械翻訳】

On the Extent of Linkage Disequilibrium in the Genome of Farm Animals

著者 (2件)： Qanbari Saber (1Leibniz Institute for Farm Animal Biology (FBN), Institute of Genetics and Biometry, Dummerstorf, Germany) ,  Qanbari Saber (2Animal Breeding and Genetics Group, Department of Animal Sciences, Center for Integrated Breeding Research, University of Gottingen, Gottingen, Germany)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 10  ページ： 1304  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子マッピングと進化的推論における連鎖不均衡(LD)の重要性を考えて,本レビューでは,LDのパターンを特性化し,家畜種のゲノム形成に及ぼす栽培,品種確立,およびその後の遺伝的改良の間の人間の介入の影響を議論する。この目的のために,ウシとニワトリ,2つの主要家畜種における配列遺伝子型対配列決定データに基づくLDのプロファイルに関するデータを要約し,ヒトの場合と比較した。この比較により,ペアワイズ対立遺伝子相関とハプロブロック構造化の実次元への洞察が得られた。LDの対立遺伝子頻度に対する依存性を示し,最近導入された緩和法について概説した。ヒトとの接触農場動物の文脈において,LDに及ぼす混合物,突然変異,組換え率,選択,および有効な個体群サイズを含む遺伝的力の影響を議論する。このレビューは,LDとホモ接合性の実行との相互作用をさらに強調し,LDに関する広く使われている関連と選択マッピング研究の操作上の意味で結論した。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *動物 ,  品種 ,  遺伝子型 ,  ヒト ,  *農場 ,  ハプロタイプ ,  突然変異 ,  個体群 ,  遺伝 ,  遺伝子頻度 ,  対立遺伝子 ,  *ゲノム ,  相互作用 ,  緩和法 ,  家畜

著者キーワード (5件)： 関連マッピング ,  選択マッピング ,  ホモ接合性の実行 ,  対立遺伝子周波数スペクトル(afs) ,  ハプロタイプブロック

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  牛  (FD02020Y)

引用文献 (96件)：

• Ai H., Huang L., Ren J. (2013). Genetic diversity, linkage disequilibrium and selection signatures in Chinese and Western pigs revealed by genome-wide SNP markers. PloS One 8, e56001. doi: doi: 10.1371/journal.pone.0056001
• Al-Mamun H. A., Clark S. A., Kwan P., Gondro C. (2015). Genome-wide linkage disequilibrium and genetic diversity in five populations of Australian domestic sheep. Genet. Selection Evol. 47, 90. doi: doi: 10.1186/s12711-015-0169-6
• Badke Y. M., Bates R. O., Ernst C. W., Schwab C., Steibel J. P. (2012). Estimation of linkage disequilibrium in four US pig breeds. BMC Genomics 13, 24. doi: doi: 10.1186/1471-2164-13-24
• Barrett J. C., Fry B., Maller J., Daly M. J. (2005). Haploview: analysis and visualization of LD and haplotype maps. Bioinformatics 21, 263-265. doi: doi: 10.1093/bioinformatics/bth457
• Baudat F., Buard J., Grey C., Fledel-Alon A., Ober C., Przeworski M., et al. (2010). PRDM9 is a major determinant of meiotic recombination hotspots in humans and mice. Science 327, 836-840. doi: doi: 10.1126/science.1183439

タイトルに関連する用語 (5件)： 農場 ,  動物 ,  ゲノム ,  連鎖不平衡 ,  程度