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J-GLOBAL ID：202002223959163551   整理番号：20A1110346

肉および卵型ニワトリのF1雑種における時空対立遺伝子特異的発現のゲノムワイド解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide analysis of spatiotemporal allele-specific expression in F1 hybrids of meat- and egg-type chickens

著者 (13件)： Ren Peng (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu Campus, Chengdu 611130, China) ,  Deng Feilong (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu Campus, Chengdu 611130, China) ,  Wang Ye (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu Campus, Chengdu 611130, China) ,  Ran Jinshan (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu Campus, Chengdu 611130, China) ,  Li Jingjing (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu Campus, Chengdu 611130, China) ,  Yin Lingqian (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu Campus, Chengdu 611130, China) ,  Liu Xianqing (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu Campus, Chengdu 611130, China) ,  Chen Shiyi (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu Campus, Chengdu 611130, China) ,  Yang Chaowu (Animal Breeding and Genetics Key Laboratory of Sichuan Province, Chengdu 610066, China) ,  Yang Chaowu (Sichuan Animal Science Academy, Chengdu 610066, China) ,  Jiang Xiaosong (Animal Breeding and Genetics Key Laboratory of Sichuan Province, Chengdu 610066, China) ,  Jiang Xiaosong (Sichuan Animal Science Academy, Chengdu 610066, China) ,  Liu Yiping (Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu Campus, Chengdu 611130, China)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 747  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 二倍体生物において,各遺伝子座は2つの親対立遺伝子から成り,表現型変異を決定するために互いに相互作用する。農場動物における対立遺伝子特異的発現(ASE)のより良い理解は,まだ十分に理解されていない経済的に重要な形質の基礎となる遺伝的基礎を探索するために非常に重要である。本研究では,ニワトリのF1雑種におけるASEの時空間的パターンを調べるために,全ゲノム解析を適用した。最初に,肉と卵型のニワトリを,フルサイブF1雑種個体群(n=57)を生産するために選択した。次に,2つの親と38の子孫のゲノム再配列を行い,肝臓と胸筋試料(n=38)を,それぞれ1,28,および56日齢で,ASE検出のために,鎖特異的RNA配列決定(ssRNA-seq)を行った。結果は,それらの親の起源に関して区別できる合計465の有益な遺伝子を正確に同定した。ASEを示す有益な遺伝子の0.4%-4.1%があり,それらのうちの57は異なる組織と時間点にわたって見つかった。さらに,ニワトリにおけるほとんどのASE遺伝子は組織特異的であり,1つのASE遺伝子の時間点パターンが,同じタイプの組織におけるすべての時間点を通して,ほぼ一貫してより高いまたはより低い発現を示した。結論として,本研究はほとんどのASE遺伝子が組織特異的で時間依存性であることを示した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  動物 ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  *ゲノム ,  農場 ,  *対立遺伝子 ,  胸筋 ,  二倍体 ,  個体群 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 表現型変異 ,  全ゲノム解析 ,  ゲノム再編成 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 対立遺伝子 ,  特異的発現 ,  ゲノム ,  トランスクリプトーム

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (9件)： 肉 ,  卵型 ,  ニワトリ ,  F1雑種 ,  時空 ,  対立遺伝子 ,  発現 ,  ゲノム ,  解析