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J-GLOBAL ID：202002224238178211   整理番号：20A1181313

地中海草原土壌のC-N化合物の代謝回転は降雨と深さに依存し,遺伝子的に多様な微生物によって媒介される【JST・京大機械翻訳】

Mediterranean grassland soil C-N compound turnover is dependent on rainfall and depth, and is mediated by genomically divergent microorganisms

著者 (16件)： Diamond Spencer (Department of Earth and Planetary Science, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA) ,  Andeer Peter F. (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, USA) ,  Li Zhou (Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN, USA) ,  Crits-Christoph Alexander (Department of Plant and Microbial Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA) ,  Burstein David (Department of Earth and Planetary Science, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA) ,  Burstein David (School of Molecular Cell Biology and Biotechnology, Tel Aviv University, Tel Aviv, Israel) ,  Anantharaman Karthik (Department of Earth and Planetary Science, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA) ,  Anantharaman Karthik (Department of Bacteriology, University of Wisconsin, Madison, WI, USA) ,  Lane Katherine R. (Department of Earth and Planetary Science, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA) ,  Thomas Brian C. (Department of Earth and Planetary Science, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA) ,  Pan Chongle (Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN, USA) ,  Pan Chongle (School of Computer Science and Department of Microbiology and Plant Biology, University of Oklahoma, Norman, OK, USA) ,  Northen Trent R. (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, USA) ,  Northen Trent R. (Joint Genome Institute, Lawrence Berkeley National Laboratory, Walnut Creek, CA, USA) ,  Banfield Jillian F. (Department of Earth and Planetary Science, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA) ,  Banfield Jillian F. (Department of Environmental Science, Policy, and Management, University of California, Berkeley, Berkeley, CA, USA)
資料名： Nature Microbiology  (Nature Microbiology)
巻： 4  号： 8  ページ： 1356-1367  発行年： 2019年 
JST資料番号： W4779A  ISSN： 2058-5276  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 土壌微生物活性は炭素及び窒素循環を駆動し,大気微量ガスターンオーバーの重要な決定因子であるが,ほとんどの土壌は未知の代謝能力を持つ微生物により支配される。土壌中の最も豊富な細菌の中でも,Acidobacteriaはほとんど特性化されておらず,Verrucomorbia,Gemmatomonadetes,ChloroflexiおよびRokubacteriumのようなグループを横切る機能は研究されていない。ここでは,地中海草地土壌生態系から60のメタゲノムおよび20のプロテオミクスデータセットを分離し,18の門から793の近完全微生物ゲノムを回収し,検出された全微生物の約1/3を表した。重要なことに,これはこれらのコミュニティに対する広範なゲノムに基づく代謝予測を可能にした。複数の以前に研究されていないクラスからのAcidobacteriaは,複雑な炭水化物分解のための大きな酵素補完をコードするゲノムを持っている。代わりに,ほとんどの微生物は,ペクチンとキシランのようなポリマーから容易にアクセス可能なメチルとアセチル基をコードする炭水化物エステラーゼをコードし,メタノールと酢酸を形成し,その利用可能性はゲノムにおけるC_1代謝と酢酸利用の高い罹患率を説明できた。3つの土壌深さで採取した試料と自然および改良した降雨条件下で採取した試料間の微生物豊度は,それぞれ深い土壌および浅い土壌における無機窒素代謝および炭素分解の統計的に高い関連性を示した。この分配は,延長された春の降雨の下でサンプルで減少し,長期の気候変化が炭素と窒素循環の両方に影響を及ぼすことができることを示している。全体として,ゲノム分解代謝プロファイルによる自然および実験的勾配を活用することにより,複合炭素,C_1,硝酸塩およびアンモニア変換における特異的役割に対する以前のゲノム特性化を欠く微生物をリンクし,土壌中のそれらの分布に影響する因子を制約した。地中海草地土壌試料のメタゲノミクスとプロテオミクスを用いて,793のメタゲノム集合ゲノムの回復をもたらし,この環境における微生物活性への洞察を提供し,これが土壌深さと拡大降雨への曝露によりどのように変化するかを示した。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature Limited 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *降雨 ,  *微生物 ,  炭素 ,  細菌 ,  アンモニア ,  硝酸塩 ,  *遺伝子 ,  ゲノム ,  窒素循環 ,  *草原 ,  プロテオミクス ,  脂肪酸 ,  薬物 ,  脂肪族アルコール
準シソーラス用語： メタゲノム ,  Acidobacteria , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

物質索引 (2件)： 酢酸 ,  メタノール

タイトルに関連する用語 (8件)： 地中海 ,  草原土壌 ,  N化合物 ,  代謝回転 ,  降雨 ,  深さ ,  遺伝子 ,  微生物